Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
A0A0J9YXV3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A0A0J9YXV3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A0A0J9YXV3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
A0A0J9YXV3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
A0A0J9YXV3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
A0A0J9YXV3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
A0A0J9YXV3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
A0A0J9YXV3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
A0A0J9YXV3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
A0A0J9YXV3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
A0A0J9YXV3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
A0A0J9YXV3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A0A0J9YXV3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
A0A0J9YXV3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A0A0J9YXV3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
A0A0J9YXV3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
A0A0J9YXV3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
A0A0J9YXV3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
A0A0J9YXV3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A0A0J9YXV3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A0A0J9YXV3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A0A0J9YXV3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
A0A0J9YXV3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
A0A0J9YXV3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
A0A0J9YXV3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
A0A0J9YXV3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
A0A0J9YXV3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
A0A0J9YXV3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A0A0J9YXV3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A0A0J9YXV3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
A0A0J9YXV3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A0A0J9YXV3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
A0A0J9YXV3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A0A0J9YXV3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A0A0J9YXV3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A0A0J9YXV3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A0A0J9YXV3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A0A0J9YXV3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0J9YXV3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A0A0J9YXV3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A0A0J9YXV3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0J9YXV3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A0A0J9YXV3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A0A0J9YXV3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0J9YXV3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0J9YXV3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0J9YXV3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0J9YXV3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A0A0J9YXV3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
A0A0J9YXV3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
A0A0J9YXV3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
A0A0J9YXV3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
A0A0J9YXV3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
A0A0J9YXV3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
A0A0J9YXV3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
A0A0J9YXV3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
A0A0J9YXV3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
A0A0J9YXV3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
A0A0J9YXV3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
A0A0J9YXV3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
A0A0J9YXV3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
A0A0J9YXV3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
A0A0J9YXV3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0J9YXV3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0J9YXV3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0J9YXV3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0J9YXV3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0J9YXV3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A0A0J9YXV3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A0A0J9YXV3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A0A0J9YXV3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A0A0J9YXV3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A0A0J9YXV3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0J9YXV3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0J9YXV3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0J9YXV3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A0A0J9YXV3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0J9YXV3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0J9YXV3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
A0A0J9YXV3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A0A0J9YXV3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0J9YXV3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0J9YXV3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0J9YXV3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0J9YXV3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A0A0J9YXV3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A0J9YXV3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
A0A0J9YXV3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A0A0J9YXV3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms