Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2A0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2A0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0B4J2A0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A0B4J2A0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A0B4J2A0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0B4J2A0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A0B4J2A0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
A0A0B4J2A0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0B4J2A0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0B4J2A0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0B4J2A0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0B4J2A0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0B4J2A0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0B4J2A0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0B4J2A0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0B4J2A0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0B4J2A0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0B4J2A0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0B4J2A0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0B4J2A0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0B4J2A0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0B4J2A0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0B4J2A0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0B4J2A0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0B4J2A0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0B4J2A0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0B4J2A0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0B4J2A0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0B4J2A0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0B4J2A0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0B4J2A0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0B4J2A0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0B4J2A0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0B4J2A0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0B4J2A0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J2A0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J2A0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J2A0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J2A0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J2A0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0B4J2A0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0B4J2A0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0B4J2A0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0B4J2A0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0B4J2A0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0B4J2A0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0B4J2A0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0B4J2A0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0B4J2A0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0B4J2A0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J2A0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J2A0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J2A0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J2A0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J2A0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0B4J2A0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0B4J2A0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0B4J2A0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0B4J2A0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0B4J2A0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0B4J2A0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0B4J2A0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0B4J2A0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0B4J2A0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0B4J2A0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0B4J2A0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0B4J2A0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0B4J2A0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0B4J2A0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0B4J2A0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0B4J2A0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0B4J2A0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0B4J2A0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0B4J2A0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0B4J2A0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0B4J2A0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0B4J2A0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0B4J2A0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J2A0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0B4J2A0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0B4J2A0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0B4J2A0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0B4J2A0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
A0A0B4J2A0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0B4J2A0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0B4J2A0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
A0A0B4J2A0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0B4J2A0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A0B4J2A0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A0B4J2A0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0B4J2A0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0B4J2A0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0B4J2A0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0B4J2A0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0B4J2A0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0B4J2A0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0B4J2A0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0B4J2A0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0B4J2A0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0B4J2A0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0B4J2A0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms