Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2A0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2A0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
A0A0B4J2A0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A0B4J2A0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A0B4J2A0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A0B4J2A0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
A0A0B4J2A0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
A0A0B4J2A0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
A0A0B4J2A0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
A0A0B4J2A0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A0B4J2A0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A0B4J2A0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A0A0B4J2A0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A0B4J2A0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A0B4J2A0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A0B4J2A0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0B4J2A0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0B4J2A0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0B4J2A0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
A0A0B4J2A0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
A0A0B4J2A0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
A0A0B4J2A0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0B4J2A0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0B4J2A0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0B4J2A0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A0B4J2A0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A0B4J2A0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A0B4J2A0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A0B4J2A0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0B4J2A0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0B4J2A0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A0B4J2A0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0B4J2A0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A0B4J2A0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0B4J2A0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A0B4J2A0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A0B4J2A0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A0B4J2A0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A0B4J2A0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0B4J2A0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0B4J2A0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0B4J2A0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0B4J2A0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0B4J2A0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0B4J2A0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0B4J2A0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
A0A0B4J2A0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0B4J2A0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0B4J2A0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A0B4J2A0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0B4J2A0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0B4J2A0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0B4J2A0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0B4J2A0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0B4J2A0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0B4J2A0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0B4J2A0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0B4J2A0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
A0A0B4J2A0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0B4J2A0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0B4J2A0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0B4J2A0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0B4J2A0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0B4J2A0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0B4J2A0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A0A0B4J2A0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
A0A0B4J2A0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A0A0B4J2A0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A0A0B4J2A0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0B4J2A0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A0A0B4J2A0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0B4J2A0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
A0A0B4J2A0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A0A0B4J2A0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A0A0B4J2A0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0B4J2A0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0B4J2A0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A0A0B4J2A0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A0A0B4J2A0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A0A0B4J2A0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0B4J2A0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A0A0B4J2A0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0B4J2A0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0B4J2A0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A0A0B4J2A0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A0A0B4J2A0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A0B4J2A0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A0B4J2A0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0B4J2A0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A0B4J2A0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A0B4J2A0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A0B4J2A0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A0B4J2A0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A0B4J2A0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0B4J2A0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0B4J2A0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A0B4J2A0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0B4J2A0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A0B4J2A0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0B4J2A0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A0B4J2A0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.3 ms