Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 GAS5-213ENST00000436285 772 ntTSL 23.78□□□□□ -1.82e-20■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.13e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.163e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.293e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-206ENST00000553444 724 ntTSL 213.09□□□□□ -0.313e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-202ENST00000420743 1559 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.333e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-230ENST00000557201 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.513e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-214ENST00000554969 1924 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.543e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-232ENST00000557442 1308 ntTSL 211.44□□□□□ -0.583e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-225ENST00000556513 1403 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.613e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-208ENST00000553753 1790 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.633e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-219ENST00000555309 1714 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.673e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-227ENST00000556897 1252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.83e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-222ENST00000555914 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.853e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-223ENST00000556142 1599 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.863e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-212ENST00000554539 748 ntTSL 59.48□□□□□ -0.893e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.053e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-211ENST00000554455 1784 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.093e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.23e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-229ENST00000557157 698 ntTSL 54.25□□□□□ -1.733e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.863e-6■□□□□ 9.1
APOBEC3CQ9NRW3 FAAP20-210ENST00000440825 855 ntTSL 330.3■■■□□ 2.441e-7■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.341e-7■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 FAAP20-207ENST00000420515 1544 ntTSL 1 (best)29.02■■■□□ 2.241e-7■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.071e-7■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 FAAP20-201ENST00000378543 569 ntTSL 225.78■■□□□ 1.721e-7■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 FAAP20-203ENST00000400918 811 ntTSL 224.38■■□□□ 1.491e-7■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 FAAP20-206ENST00000414253 2216 ntTSL 223.9■■□□□ 1.421e-7■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 FAAP20-209ENST00000428120 2313 ntTSL 1 (best)23.39■■□□□ 1.331e-7■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 FAAP20-212ENST00000476803 701 ntTSL 219.96■□□□□ 0.791e-7■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 FAAP20-205ENST00000401813 2543 ntTSL 1 (best)17.75■□□□□ 0.431e-7■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 FAAP20-211ENST00000469733 2280 ntTSL 217.19■□□□□ 0.341e-7■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.11e-7■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 FAAP20-214ENST00000497675 4478 ntTSL 215.39■□□□□ 0.051e-7■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.031e-7■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.171e-7■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 FAAP20-213ENST00000487186 3576 ntTSL 212.74□□□□□ -0.371e-7■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 YWHAZ-217ENST00000521328 511 ntTSL 511.35□□□□□ -0.591e-7■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5H-204ENST00000580649 2191 ntTSL 29.34□□□□□ -0.911e-7■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 LRRC75A-AS1-230ENST00000584926 604 ntTSL 58.32□□□□□ -1.088e-8■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 RNA5SP370-201ENST00000362545 121 ntBASIC11.82□□□□□ -0.522e-8■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 PABPN1-208ENST00000557702 778 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.73e-8■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 RPS4X-202ENST00000373626 594 ntTSL 39.04□□□□□ -0.963e-20■□□□□ 9
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.34e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2G2-206ENST00000481546 4340 ntTSL 1 (best)9.04□□□□□ -0.964e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.58e-13■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 RPS27A-203ENST00000404735 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.558e-13■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 RPS27A-202ENST00000402285 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.628e-13■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 RPS27A-210ENST00000495843 1159 ntTSL 58.35□□□□□ -1.078e-13■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 SUB1-205ENST00000504789 570 ntTSL 421.48■■□□□ 1.033e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 CD63-203ENST00000546457 607 ntTSL 215.06■□□□□ 03e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.033e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 CDC45-212ENST00000493724 469 ntTSL 214.31□□□□□ -0.123e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.193e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.353e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 SUB1-213ENST00000515355 771 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.413e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 CDC45-203ENST00000407835 2090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.443e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 AARS-201ENST00000261772 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.643e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 HK1-202ENST00000359426 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.683e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 HK1-201ENST00000298649 3596 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.713e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 HK1-206ENST00000448642 3868 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.833e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 SUB1-209ENST00000511615 1658 ntTSL 1 (best)9.43□□□□□ -0.93e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 HK1-203ENST00000360289 3961 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -13e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 SUB1-201ENST00000265073 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.013e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.783e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 SUB1-202ENST00000502453 4273 ntTSL 1 (best)3.56□□□□□ -1.843e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 SUB1-204ENST00000504016 509 ntTSL 33.03□□□□□ -1.923e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.923e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 SUB1-212ENST00000513013 493 ntTSL 52.74□□□□□ -1.973e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.023e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 SUB1-208ENST00000511175 636 ntTSL 22.04□□□□□ -2.083e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.052e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.122e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 UBA1-203ENST00000377351 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.972e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.132e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.092e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA11-203ENST00000591160 604 ntTSL 321.51■■□□□ 1.037e-9■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF2-206ENST00000582449 1518 ntTSL 220.78■□□□□ 0.922e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.862e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.817e-9■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.742e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 AC024592.3-203ENST00000585661 431 ntAPPRIS P1 TSL 218.33■□□□□ 0.527e-9■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.527e-9■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.497e-9■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA11-206ENST00000593233 657 ntTSL 317.76■□□□□ 0.437e-9■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF2-204ENST00000452355 1357 ntTSL 517.42■□□□□ 0.382e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 AC024592.3-201ENST00000592091 2118 ntTSL 217.02■□□□□ 0.317e-9■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.297e-9■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.252e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF2-208ENST00000585202 1359 ntTSL 315.58■□□□□ 0.082e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 ARL2-203ENST00000529254 601 nt15.54■□□□□ 0.082e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.047e-9■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.232e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.242e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.312e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.322e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 ISYNA1-212ENST00000583309 371 ntTSL 212.59□□□□□ -0.392e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.457e-9■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 ARL2-206ENST00000533729 795 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.522e-6■□□□□ 8.9
APOBEC3CQ9NRW3 ELOB-203ENST00000409906 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.537e-9■□□□□ 8.9
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