RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.4■■■■□ 3.58
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.29■■■□□ 2.76
FAAP20-211ENST00000469733 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
FAAP20-211ENST00000469733 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.06■■■□□ 2.56
FAAP20-211ENST00000469733 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.86■■■□□ 2.53
FAAP20-211ENST00000469733 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.82■■■□□ 2.52
FAAP20-211ENST00000469733 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.26■■■□□ 2.43
FAAP20-211ENST00000469733 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
FAAP20-211ENST00000469733 ABCC9O60706 1549 aa30.1■■■□□ 2.41
FAAP20-211ENST00000469733 NACADO15069 1562 aa29.94■■■□□ 2.38
FAAP20-211ENST00000469733 SCRIBQ14160 1630 aa29.88■■■□□ 2.37
FAAP20-211ENST00000469733 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.56■■■□□ 2.32
FAAP20-211ENST00000469733 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.28
FAAP20-211ENST00000469733 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-211ENST00000469733 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.06■■■□□ 2.24
FAAP20-211ENST00000469733 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.03■■■□□ 2.24
FAAP20-211ENST00000469733 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.95■■■□□ 2.22
FAAP20-211ENST00000469733 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
FAAP20-211ENST00000469733 WIZO95785 1651 aa28.77■■■□□ 2.2
FAAP20-211ENST00000469733 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.68■■■□□ 2.18
FAAP20-211ENST00000469733 SMARCA4P51532 1647 aa28.64■■■□□ 2.18
FAAP20-211ENST00000469733 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.16
FAAP20-211ENST00000469733 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
FAAP20-211ENST00000469733 TRIM41Q8WV44 630 aa28.3■■■□□ 2.12
FAAP20-211ENST00000469733 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-211ENST00000469733 SMARCA2P51531 1590 aa28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-211ENST00000469733 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.19■■■□□ 2.1
FAAP20-211ENST00000469733 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-211ENST00000469733 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.01■■■□□ 2.07
FAAP20-211ENST00000469733 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
FAAP20-211ENST00000469733 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
FAAP20-211ENST00000469733 ABCC8Q09428 1581 aa27.83■■■□□ 2.05
FAAP20-211ENST00000469733 HMGXB3Q12766 1538 aa27.65■■■□□ 2.02
FAAP20-211ENST00000469733 NCAPD3P42695 1498 aa27.63■■■□□ 2.01
FAAP20-211ENST00000469733 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.54■■■□□ 2
FAAP20-211ENST00000469733 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.49■■□□□ 1.99
FAAP20-211ENST00000469733 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.48■■□□□ 1.99
FAAP20-211ENST00000469733 EEA1Q15075 1411 aa27.43■■□□□ 1.98
FAAP20-211ENST00000469733 SOGA1O94964 1423 aa27.42■■□□□ 1.98
FAAP20-211ENST00000469733 SYNJ1O43426 1573 aa27.42■■□□□ 1.98
FAAP20-211ENST00000469733 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.28■■□□□ 1.96
FAAP20-211ENST00000469733 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
FAAP20-211ENST00000469733 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.26■■□□□ 1.95
FAAP20-211ENST00000469733 TOP2BQ02880 1626 aa27.22■■□□□ 1.95
FAAP20-211ENST00000469733 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.22■■□□□ 1.95
FAAP20-211ENST00000469733 CFTRP13569 1480 aa27.21■■□□□ 1.95
FAAP20-211ENST00000469733 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.18■■□□□ 1.94
FAAP20-211ENST00000469733 HRCP23327 699 aa27.15■■□□□ 1.94
FAAP20-211ENST00000469733 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.13■■□□□ 1.93
FAAP20-211ENST00000469733 GOLGA3Q08378 1498 aa27.11■■□□□ 1.93
FAAP20-211ENST00000469733 PRDM2Q13029 1718 aa27.11■■□□□ 1.93
FAAP20-211ENST00000469733 CEP162Q5TB80 1403 aa27.07■■□□□ 1.92
FAAP20-211ENST00000469733 KIF21BO75037 1637 aa27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-211ENST00000469733 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-211ENST00000469733 CUX1P39880 1505 aa27.03■■□□□ 1.92
FAAP20-211ENST00000469733 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-211ENST00000469733 CADPSQ9ULU8 1353 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-211ENST00000469733 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.83■■□□□ 1.89
FAAP20-211ENST00000469733 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-211ENST00000469733 KIF27Q86VH2 1401 aa26.78■■□□□ 1.88
FAAP20-211ENST00000469733 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.76■■□□□ 1.87
FAAP20-211ENST00000469733 PRXQ9BXM0 1461 aa26.74■■□□□ 1.87
FAAP20-211ENST00000469733 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-211ENST00000469733 CLIP1P30622 1438 aa26.72■■□□□ 1.87
FAAP20-211ENST00000469733 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.64■■□□□ 1.86
FAAP20-211ENST00000469733 NESP48681 1621 aa26.62■■□□□ 1.85
FAAP20-211ENST00000469733 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.61■■□□□ 1.85
FAAP20-211ENST00000469733 CUX2O14529 1486 aa26.6■■□□□ 1.85
FAAP20-211ENST00000469733 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.58■■□□□ 1.85
FAAP20-211ENST00000469733 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.56■■□□□ 1.84
FAAP20-211ENST00000469733 TOPBP1Q92547 1522 aa26.5■■□□□ 1.83
FAAP20-211ENST00000469733 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
FAAP20-211ENST00000469733 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-211ENST00000469733 IGF1RP08069 1367 aa26.47■■□□□ 1.83
FAAP20-211ENST00000469733 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
FAAP20-211ENST00000469733 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-211ENST00000469733 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.4■■□□□ 1.82
FAAP20-211ENST00000469733 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.39■■□□□ 1.82
FAAP20-211ENST00000469733 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.39■■□□□ 1.82
FAAP20-211ENST00000469733 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.37■■□□□ 1.81
FAAP20-211ENST00000469733 ARAP1Q96P48 1450 aa26.37■■□□□ 1.81
FAAP20-211ENST00000469733 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.36■■□□□ 1.81
FAAP20-211ENST00000469733 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
FAAP20-211ENST00000469733 APLP2Q06481 763 aa26.35■■□□□ 1.81
FAAP20-211ENST00000469733 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.29■■□□□ 1.8
FAAP20-211ENST00000469733 WDR97A6NE52 1622 aa26.26■■□□□ 1.79
FAAP20-211ENST00000469733 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.25■■□□□ 1.79
FAAP20-211ENST00000469733 CUL7Q14999 1698 aa26.21■■□□□ 1.79
FAAP20-211ENST00000469733 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
FAAP20-211ENST00000469733 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
FAAP20-211ENST00000469733 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.14■■□□□ 1.77
FAAP20-211ENST00000469733 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.06■■□□□ 1.76
FAAP20-211ENST00000469733 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
FAAP20-211ENST00000469733 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
FAAP20-211ENST00000469733 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.03■■□□□ 1.76
FAAP20-211ENST00000469733 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.03■■□□□ 1.76
FAAP20-211ENST00000469733 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
FAAP20-211ENST00000469733 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.97■■□□□ 1.75
FAAP20-211ENST00000469733 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms