RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.1■■■■■ 5.77
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.09■■■■■ 4.65
FAAP20-209ENST00000428120 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
FAAP20-209ENST00000428120 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.54■■■■■ 4.4
FAAP20-209ENST00000428120 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.49■■■■■ 4.39
FAAP20-209ENST00000428120 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.03■■■■■ 4.32
FAAP20-209ENST00000428120 ABCC9O60706 1549 aa41.63■■■■■ 4.25
FAAP20-209ENST00000428120 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.26■■■■■ 4.2
FAAP20-209ENST00000428120 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
FAAP20-209ENST00000428120 NACADO15069 1562 aa40.99■■■■■ 4.15
FAAP20-209ENST00000428120 SCRIBQ14160 1630 aa40.99■■■■■ 4.15
FAAP20-209ENST00000428120 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.56■■■■■ 4.08
FAAP20-209ENST00000428120 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
FAAP20-209ENST00000428120 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.89■■■■□ 3.98
FAAP20-209ENST00000428120 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.85■■■■□ 3.97
FAAP20-209ENST00000428120 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.62■■■■□ 3.93
FAAP20-209ENST00000428120 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.54■■■■□ 3.92
FAAP20-209ENST00000428120 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.51■■■■□ 3.91
FAAP20-209ENST00000428120 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.44■■■■□ 3.9
FAAP20-209ENST00000428120 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.36■■■■□ 3.89
FAAP20-209ENST00000428120 WIZO95785 1651 aa39.36■■■■□ 3.89
FAAP20-209ENST00000428120 SMARCA4P51532 1647 aa39.17■■■■□ 3.86
FAAP20-209ENST00000428120 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.53■■■■□ 3.76
FAAP20-209ENST00000428120 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.52■■■■□ 3.76
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM41Q8WV44 630 aa38.51■■■■□ 3.76
FAAP20-209ENST00000428120 SMARCA2P51531 1590 aa38.51■■■■□ 3.76
FAAP20-209ENST00000428120 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.42■■■■□ 3.74
FAAP20-209ENST00000428120 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.37■■■■□ 3.73
FAAP20-209ENST00000428120 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.25■■■■□ 3.71
FAAP20-209ENST00000428120 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.24■■■■□ 3.71
FAAP20-209ENST00000428120 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.06■■■■□ 3.68
FAAP20-209ENST00000428120 ABCC8Q09428 1581 aa38.03■■■■□ 3.68
FAAP20-209ENST00000428120 NCAPD3P42695 1498 aa37.9■■■■□ 3.66
FAAP20-209ENST00000428120 HMGXB3Q12766 1538 aa37.84■■■■□ 3.65
FAAP20-209ENST00000428120 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.71■■■■□ 3.63
FAAP20-209ENST00000428120 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.58■■■■□ 3.61
FAAP20-209ENST00000428120 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.55■■■■□ 3.6
FAAP20-209ENST00000428120 SYNJ1O43426 1573 aa37.44■■■■□ 3.58
FAAP20-209ENST00000428120 SOGA1O94964 1423 aa37.43■■■■□ 3.58
FAAP20-209ENST00000428120 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.29■■■■□ 3.56
FAAP20-209ENST00000428120 CFTRP13569 1480 aa37.26■■■■□ 3.56
FAAP20-209ENST00000428120 EEA1Q15075 1411 aa37.14■■■■□ 3.54
FAAP20-209ENST00000428120 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.13■■■■□ 3.53
FAAP20-209ENST00000428120 TOP2BQ02880 1626 aa37.12■■■■□ 3.53
FAAP20-209ENST00000428120 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.07■■■■□ 3.52
FAAP20-209ENST00000428120 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.05■■■■□ 3.52
FAAP20-209ENST00000428120 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.02■■■■□ 3.52
FAAP20-209ENST00000428120 CUX1P39880 1505 aa36.98■■■■□ 3.51
FAAP20-209ENST00000428120 PRDM2Q13029 1718 aa36.98■■■■□ 3.51
FAAP20-209ENST00000428120 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA3Q08378 1498 aa36.8■■■■□ 3.48
FAAP20-209ENST00000428120 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.79■■■■□ 3.48
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.77■■■■□ 3.48
FAAP20-209ENST00000428120 CEP162Q5TB80 1403 aa36.75■■■■□ 3.47
FAAP20-209ENST00000428120 NESP48681 1621 aa36.75■■■■□ 3.47
FAAP20-209ENST00000428120 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.73■■■■□ 3.47
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
FAAP20-209ENST00000428120 KIF21BO75037 1637 aa36.69■■■■□ 3.46
FAAP20-209ENST00000428120 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.69■■■■□ 3.46
FAAP20-209ENST00000428120 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.6■■■■□ 3.45
FAAP20-209ENST00000428120 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.56■■■■□ 3.44
FAAP20-209ENST00000428120 KIF27Q86VH2 1401 aa36.53■■■■□ 3.44
FAAP20-209ENST00000428120 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.5■■■■□ 3.43
FAAP20-209ENST00000428120 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.49■■■■□ 3.43
FAAP20-209ENST00000428120 PRXQ9BXM0 1461 aa36.41■■■■□ 3.42
FAAP20-209ENST00000428120 CUX2O14529 1486 aa36.41■■■■□ 3.42
FAAP20-209ENST00000428120 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.36■■■■□ 3.41
FAAP20-209ENST00000428120 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
FAAP20-209ENST00000428120 TOPBP1Q92547 1522 aa36.34■■■■□ 3.41
FAAP20-209ENST00000428120 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.32■■■■□ 3.4
FAAP20-209ENST00000428120 CLIP1P30622 1438 aa36.32■■■■□ 3.4
FAAP20-209ENST00000428120 HRCP23327 699 aa36.3■■■■□ 3.4
FAAP20-209ENST00000428120 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.26■■■■□ 3.4
FAAP20-209ENST00000428120 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
FAAP20-209ENST00000428120 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.23■■■■□ 3.39
FAAP20-209ENST00000428120 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
FAAP20-209ENST00000428120 IGF1RP08069 1367 aa36.21■■■■□ 3.39
FAAP20-209ENST00000428120 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
FAAP20-209ENST00000428120 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.17■■■■□ 3.38
FAAP20-209ENST00000428120 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.08■■■■□ 3.37
FAAP20-209ENST00000428120 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.04■■■■□ 3.36
FAAP20-209ENST00000428120 VPS8Q8N3P4 1428 aa36.02■■■■□ 3.36
FAAP20-209ENST00000428120 ARAP1Q96P48 1450 aa35.88■■■■□ 3.33
FAAP20-209ENST00000428120 WDR97A6NE52 1622 aa35.88■■■■□ 3.33
FAAP20-209ENST00000428120 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
FAAP20-209ENST00000428120 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.78■■■■□ 3.32
FAAP20-209ENST00000428120 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.77■■■■□ 3.32
FAAP20-209ENST00000428120 APLP2Q06481 763 aa35.77■■■■□ 3.32
FAAP20-209ENST00000428120 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.74■■■■□ 3.31
FAAP20-209ENST00000428120 CUL7Q14999 1698 aa35.72■■■■□ 3.31
FAAP20-209ENST00000428120 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.71■■■■□ 3.31
FAAP20-209ENST00000428120 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
FAAP20-209ENST00000428120 ERCC6Q03468 1493 aa35.57■■■■□ 3.28
FAAP20-209ENST00000428120 WDR62O43379 1518 aa35.52■■■■□ 3.28
FAAP20-209ENST00000428120 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.52■■■■□ 3.282e-6■■□□□ 13.2
FAAP20-209ENST00000428120 P3H3Q8IVL6 736 aa35.49■■■■□ 3.27
FAAP20-209ENST00000428120 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
FAAP20-209ENST00000428120 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.46■■■■□ 3.27
FAAP20-209ENST00000428120 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms