RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420515.1

FAAP20-207, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 1,544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-207ENST00000420515 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.99■■■■■ 7.99
FAAP20-207ENST00000420515 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.49■■■■■ 6.79
FAAP20-207ENST00000420515 ABCC9O60706 1549 aa55.65■■■■■ 6.5
FAAP20-207ENST00000420515 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.3■■■■■ 6.28
FAAP20-207ENST00000420515 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.98■■■■■ 6.23
FAAP20-207ENST00000420515 NACADO15069 1562 aa53.81■■■■■ 6.21
FAAP20-207ENST00000420515 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.74■■■■■ 6.19
FAAP20-207ENST00000420515 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.72■■■■■ 6.19
FAAP20-207ENST00000420515 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.65■■■■■ 6.18
FAAP20-207ENST00000420515 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.81■■■■■ 6.04
FAAP20-207ENST00000420515 SCRIBQ14160 1630 aa52.62■■■■■ 6.01
FAAP20-207ENST00000420515 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.23■■■■■ 5.95
FAAP20-207ENST00000420515 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.1■■■■■ 5.93
FAAP20-207ENST00000420515 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.85■■■■■ 5.89
FAAP20-207ENST00000420515 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.73■■■■■ 5.71
FAAP20-207ENST00000420515 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.64■■■■■ 5.7
FAAP20-207ENST00000420515 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.5■■■■■ 5.67
FAAP20-207ENST00000420515 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.39■■■■■ 5.66
FAAP20-207ENST00000420515 SMARCA4P51532 1647 aa50.34■■■■■ 5.65
FAAP20-207ENST00000420515 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.29■■■■■ 5.64
FAAP20-207ENST00000420515 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.17■■■■■ 5.62
FAAP20-207ENST00000420515 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.83■■■■■ 5.57
FAAP20-207ENST00000420515 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.77■■■■■ 5.56
FAAP20-207ENST00000420515 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.77■■■■■ 5.56
FAAP20-207ENST00000420515 SMARCA2P51531 1590 aa49.75■■■■■ 5.55
FAAP20-207ENST00000420515 WIZO95785 1651 aa49.74■■■■■ 5.55
FAAP20-207ENST00000420515 NCAPD3P42695 1498 aa49.64■■■■■ 5.54
FAAP20-207ENST00000420515 HMGXB3Q12766 1538 aa49.5■■■■■ 5.52
FAAP20-207ENST00000420515 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.44■■■■■ 5.51
FAAP20-207ENST00000420515 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.12■■■■■ 5.45
FAAP20-207ENST00000420515 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.02■■■■■ 5.44
FAAP20-207ENST00000420515 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.55■■■■■ 5.36
FAAP20-207ENST00000420515 NESP48681 1621 aa48.42■■■■■ 5.34
FAAP20-207ENST00000420515 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.26■■■■■ 5.32
FAAP20-207ENST00000420515 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.22■■■■■ 5.31
FAAP20-207ENST00000420515 CFTRP13569 1480 aa48.11■■■■■ 5.29
FAAP20-207ENST00000420515 PRDM2Q13029 1718 aa47.98■■■■■ 5.27
FAAP20-207ENST00000420515 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.92■■■■■ 5.26
FAAP20-207ENST00000420515 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.82■■■■■ 5.25
FAAP20-207ENST00000420515 ERCC6Q03468 1493 aa47.81■■■■■ 5.24
FAAP20-207ENST00000420515 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.73■■■■■ 5.23
FAAP20-207ENST00000420515 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.59■■■■■ 5.21
FAAP20-207ENST00000420515 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.53■■■■■ 5.2
FAAP20-207ENST00000420515 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.38■■■■■ 5.18
FAAP20-207ENST00000420515 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.27■■■■■ 5.16
FAAP20-207ENST00000420515 WDR62O43379 1518 aa47.25■■■■■ 5.15
FAAP20-207ENST00000420515 ABCC8Q09428 1581 aa47.1■■■■■ 5.13
FAAP20-207ENST00000420515 TOPBP1Q92547 1522 aa47.07■■■■■ 5.13
FAAP20-207ENST00000420515 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.07■■■■■ 5.12
FAAP20-207ENST00000420515 CUX2O14529 1486 aa47.03■■■■■ 5.12
FAAP20-207ENST00000420515 CUX1P39880 1505 aa47.02■■■■■ 5.12
FAAP20-207ENST00000420515 SYNJ1O43426 1573 aa46.87■■■■■ 5.09
FAAP20-207ENST00000420515 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.87■■■■■ 5.09
FAAP20-207ENST00000420515 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.79■■■■■ 5.08
FAAP20-207ENST00000420515 TOP2BQ02880 1626 aa46.76■■■■■ 5.08
FAAP20-207ENST00000420515 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.72■■■■■ 5.07
FAAP20-207ENST00000420515 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.72■■■■■ 5.07
FAAP20-207ENST00000420515 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.56■■■■■ 5.04
FAAP20-207ENST00000420515 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.56■■■■■ 5.04
FAAP20-207ENST00000420515 IFT140Q96RY7 1462 aa46.52■■■■■ 5.04
FAAP20-207ENST00000420515 SOGA1O94964 1423 aa46.47■■■■■ 5.03
FAAP20-207ENST00000420515 WDR97A6NE52 1622 aa46.41■■■■■ 5.02
FAAP20-207ENST00000420515 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.4■■■■■ 5.02
FAAP20-207ENST00000420515 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.27■■■■■ 5
FAAP20-207ENST00000420515 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.25■■■■■ 4.99
FAAP20-207ENST00000420515 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.18■■■■■ 4.98
FAAP20-207ENST00000420515 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.17■■■■■ 4.98
FAAP20-207ENST00000420515 TRIM41Q8WV44 630 aa46.17■■■■■ 4.98
FAAP20-207ENST00000420515 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.13■■■■■ 4.97
FAAP20-207ENST00000420515 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.1■■■■■ 4.97
FAAP20-207ENST00000420515 PBRM1Q86U86 1689 aa45.99■■■■■ 4.95
FAAP20-207ENST00000420515 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.97■■■■■ 4.95
FAAP20-207ENST00000420515 GRIN2BQ13224 1484 aa45.84■■■■■ 4.93
FAAP20-207ENST00000420515 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.79■■■■■ 4.92
FAAP20-207ENST00000420515 KIF27Q86VH2 1401 aa45.78■■■■■ 4.92
FAAP20-207ENST00000420515 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.78■■■■■ 4.92
FAAP20-207ENST00000420515 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.69■■■■■ 4.9
FAAP20-207ENST00000420515 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.64■■■■■ 4.9
FAAP20-207ENST00000420515 CHD1O14646 1710 aa45.62■■■■■ 4.89
FAAP20-207ENST00000420515 ADAMTS12P58397 1594 aa45.6■■■■■ 4.89
FAAP20-207ENST00000420515 IGF1RP08069 1367 aa45.55■■■■■ 4.88
FAAP20-207ENST00000420515 SYNJ2O15056 1496 aa45.47■■■■■ 4.87
FAAP20-207ENST00000420515 CUL7Q14999 1698 aa45.45■■■■■ 4.87
FAAP20-207ENST00000420515 FBLN2P98095 1184 aa45.42■■■■■ 4.86
FAAP20-207ENST00000420515 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.41■■■■■ 4.86
FAAP20-207ENST00000420515 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.34■■■■■ 4.85
FAAP20-207ENST00000420515 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP45.32■■■■■ 4.85
FAAP20-207ENST00000420515 GRIN2AQ12879 1464 aa45.3■■■■■ 4.84
FAAP20-207ENST00000420515 EEA1Q15075 1411 aa45.3■■■■■ 4.84
FAAP20-207ENST00000420515 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.28■■■■■ 4.84
FAAP20-207ENST00000420515 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.19■■■■■ 4.82
FAAP20-207ENST00000420515 OSCARQ8IYS5 282 aa45.15■■■■■ 4.82
FAAP20-207ENST00000420515 PRXQ9BXM0 1461 aa45.15■■■■■ 4.82
FAAP20-207ENST00000420515 CEP170Q5SW79 1584 aa45.14■■■■■ 4.82
FAAP20-207ENST00000420515 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.1■■■■■ 4.81
FAAP20-207ENST00000420515 NUP160Q12769 1436 aa45.06■■■■■ 4.8
FAAP20-207ENST00000420515 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.03■■■■■ 4.8
FAAP20-207ENST00000420515 KIF21BO75037 1637 aa44.94■■■■■ 4.78
FAAP20-207ENST00000420515 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.81■■■■■ 4.76
FAAP20-207ENST00000420515 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.78■■■■■ 4.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.9 ms