Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGY1

NOL12, Nucleolar protein 12, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL12Q9UGY1 LGALS3BP-207ENST00000587311 1905 ntTSL 217.7■□□□□ 0.427e-9■□□□□ 10.5
NOL12Q9UGY1 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.027e-9■□□□□ 10.5
NOL12Q9UGY1 SEMA3B-208ENST00000456210 2065 ntTSL 222.13■■□□□ 1.137e-13■□□□□ 10.5
NOL12Q9UGY1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.927e-13■□□□□ 10.5
NOL12Q9UGY1 SEMA3B-207ENST00000441915 2710 ntTSL 1 (best)18.99■□□□□ 0.637e-13■□□□□ 10.5
NOL12Q9UGY1 SEMA3B-206ENST00000439487 594 ntTSL 318.78■□□□□ 0.67e-13■□□□□ 10.5
NOL12Q9UGY1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.557e-13■□□□□ 10.5
NOL12Q9UGY1 SNRNP70-203ENST00000544278 3221 ntTSL 1 (best)18.28■□□□□ 0.527e-13■□□□□ 10.5
NOL12Q9UGY1 SEMA3B-203ENST00000419007 3283 ntTSL 217.76■□□□□ 0.437e-13■□□□□ 10.5
NOL12Q9UGY1 MST1-205ENST00000480268 648 ntTSL 315.38■□□□□ 0.057e-13■□□□□ 10.5
NOL12Q9UGY1 MST1-218ENST00000494809 859 ntTSL 314.24□□□□□ -0.137e-13■□□□□ 10.5
NOL12Q9UGY1 PLXNB1-214ENST00000478171 576 ntTSL 314.09□□□□□ -0.157e-13■□□□□ 10.5
NOL12Q9UGY1 MST1-203ENST00000468847 406 ntTSL 212.7□□□□□ -0.387e-13■□□□□ 10.5
NOL12Q9UGY1 LGALS3BP-219ENST00000592255 556 ntTSL 211.62□□□□□ -0.554e-8■□□□□ 10.5
NOL12Q9UGY1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.391e-6■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 LRP5-206ENST00000529993 5103 ntTSL 1 (best)17.2■□□□□ 0.341e-6■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 CTSD-205ENST00000438213 946 ntTSL 215.58■□□□□ 0.085e-8■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.654e-18■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.154e-18■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.94e-18■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.624e-18■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 PPAN-205ENST00000446223 844 ntTSL 318.06■□□□□ 0.484e-18■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.584e-8■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.524e-8■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.674e-8■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 CDK5RAP3-225ENST00000582482 2455 ntTSL 212.34□□□□□ -0.434e-8■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 SFPQ-202ENST00000460428 464 ntTSL 28.61□□□□□ -1.034e-8■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 CDK5RAP3-211ENST00000578996 566 ntTSL 28.22□□□□□ -1.094e-8■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 CDK5RAP3-229ENST00000583697 852 ntTSL 38.18□□□□□ -1.14e-8■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 SMAD3-211ENST00000559460 568 ntTSL 47.6□□□□□ -1.194e-8■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 CDK5RAP3-209ENST00000578663 949 ntTSL 36.73□□□□□ -1.334e-8■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 SFPQ-206ENST00000470472 874 ntTSL 53.97□□□□□ -1.774e-8■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 AMBP-202ENST00000466610 579 ntTSL 310.76□□□□□ -0.693e-29■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 ERBB2-214ENST00000583038 4930 ntTSL 218.33■□□□□ 0.521e-6■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.927e-7■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.087e-7■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.72e-7■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.362e-7■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 LAMA5-204ENST00000462415 585 ntTSL 216.53■□□□□ 0.241e-16■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.965e-7■□□□□ 10.4
NOL12Q9UGY1 GSN-213ENST00000483960 802 ntTSL 311.03□□□□□ -0.645e-9■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 AP1G2-216ENST00000554982 716 ntTSL 412.26□□□□□ -0.451e-7■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 AP1G2-217ENST00000555118 362 ntTSL 512.11□□□□□ -0.471e-7■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SEC63-203ENST00000446496 583 ntTSL 417.62■□□□□ 0.419e-7■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 STT3A-216ENST00000534472 1561 ntTSL 1 (best)17.45■□□□□ 0.389e-7■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.379e-7■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.339e-7■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 CCT3-206ENST00000368262 2048 ntTSL 216.45■□□□□ 0.229e-7■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.059e-7■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.049e-7■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 STT3A-210ENST00000527606 569 ntTSL 414.87□□□□□ -0.039e-7■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 CCT3-203ENST00000368258 1885 ntTSL 214.38□□□□□ -0.119e-7■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 CCT3-205ENST00000368261 863 ntTSL 511.4□□□□□ -0.589e-7■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SEC63-205ENST00000460009 482 ntTSL 510.19□□□□□ -0.789e-7■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SEC63-209ENST00000484803 724 ntTSL 26.59□□□□□ -1.359e-7■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 STT3A-204ENST00000525652 607 ntTSL 26.15□□□□□ -1.429e-7■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 STT3A-212ENST00000529886 542 ntTSL 45.32□□□□□ -1.569e-7■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.455e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.335e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.252e-46■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SNHG12-206ENST00000474814 1903 ntTSL 219.98■□□□□ 0.792e-46■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 NUCB1-212ENST00000492367 1515 ntTSL 219.77■□□□□ 0.765e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.765e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SNHG12-201ENST00000461448 1629 ntTSL 1 (best)19.6■□□□□ 0.732e-46■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 FBXO17-203ENST00000596025 935 ntTSL 218.95■□□□□ 0.625e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 NBEAL2-201ENST00000416683 6364 ntTSL 1 (best)18.85■□□□□ 0.615e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.575e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.475e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.425e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 CDK5RAP2-214ENST00000481266 970 ntTSL 517.2■□□□□ 0.345e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.335e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.325e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.315e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.295e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.285e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SNHG12-208ENST00000481220 751 ntTSL 316.63■□□□□ 0.252e-46■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 ATP7B-210ENST00000634296 2328 ntTSL 515.69■□□□□ 0.15e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.095e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.065e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SNRNP200-202ENST00000429650 2637 ntTSL 215.3■□□□□ 0.045e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 ATP7B-214ENST00000634810 5825 ntTSL 1 (best)15.26■□□□□ 0.035e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.015e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SMARCA4-216ENST00000591545 5193 ntTSL 214.87□□□□□ -0.035e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.035e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 TGOLN2-206ENST00000444342 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.095e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.175e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.255e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 TGOLN2-202ENST00000377386 6489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.285e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SNHG12-209ENST00000481368 1588 ntTSL 1 (best)13.28□□□□□ -0.282e-46■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SNRNP200-208ENST00000497539 2666 ntTSL 1 (best)13.28□□□□□ -0.285e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 PLXNB2-204ENST00000427829 567 ntTSL 413.19□□□□□ -0.35e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 C2-216ENST00000494905 536 ntTSL 412.91□□□□□ -0.347e-14■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.352e-46■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 ATP7B-201ENST00000242839 6638 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.355e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SORL1-206ENST00000527934 3032 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.425e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SNRNP200-201ENST00000323853 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.435e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 ATP7B-213ENST00000634620 5653 ntTSL 1 (best)12.34□□□□□ -0.435e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 SNHG12-205ENST00000470977 1098 ntTSL 1 (best)11.92□□□□□ -0.52e-46■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 ATP7B-204ENST00000400370 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.515e-6■□□□□ 10.3
NOL12Q9UGY1 ATP7B-205ENST00000418097 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.565e-6■□□□□ 10.3
Retrieved 100 of 4,605 protein–RNA pairs in 24.5 ms