RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418576.3

SEMA3B-202, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

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Gene SEMA3B, Length 1,765 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-202ENST00000418576 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.89■■■■■ 4.62
SEMA3B-202ENST00000418576 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.78■■■■□ 3.8
SEMA3B-202ENST00000418576 ABCC9O60706 1549 aa37.54■■■■□ 3.6
SEMA3B-202ENST00000418576 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
SEMA3B-202ENST00000418576 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.61■■■■□ 3.45
SEMA3B-202ENST00000418576 NACADO15069 1562 aa36.4■■■■□ 3.42
SEMA3B-202ENST00000418576 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.34■■■■□ 3.41
SEMA3B-202ENST00000418576 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.33■■■■□ 3.41
SEMA3B-202ENST00000418576 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.32■■■■□ 3.4
SEMA3B-202ENST00000418576 SCRIBQ14160 1630 aa35.44■■■■□ 3.26
SEMA3B-202ENST00000418576 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.4■■■■□ 3.26
SEMA3B-202ENST00000418576 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.2■■■■□ 3.234e-8■■■■□ 20
SEMA3B-202ENST00000418576 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.14■■■■□ 3.22
SEMA3B-202ENST00000418576 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.99■■■■□ 3.19
SEMA3B-202ENST00000418576 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
SEMA3B-202ENST00000418576 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.13■■■■□ 3.05
SEMA3B-202ENST00000418576 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
SEMA3B-202ENST00000418576 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34■■■■□ 3.03
SEMA3B-202ENST00000418576 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.96■■■■□ 3.03
SEMA3B-202ENST00000418576 SMARCA4P51532 1647 aa33.94■■■■□ 3.02
SEMA3B-202ENST00000418576 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.81■■■■□ 3
SEMA3B-202ENST00000418576 SMARCA2P51531 1590 aa33.66■■■□□ 2.98
SEMA3B-202ENST00000418576 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.66■■■□□ 2.98
SEMA3B-202ENST00000418576 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
SEMA3B-202ENST00000418576 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.6■■■□□ 2.97
SEMA3B-202ENST00000418576 NCAPD3P42695 1498 aa33.59■■■□□ 2.97
SEMA3B-202ENST00000418576 WIZO95785 1651 aa33.47■■■□□ 2.95
SEMA3B-202ENST00000418576 HMGXB3Q12766 1538 aa33.44■■■□□ 2.94
SEMA3B-202ENST00000418576 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
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SEMA3B-202ENST00000418576 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
SEMA3B-202ENST00000418576 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.78■■■□□ 2.84
SEMA3B-202ENST00000418576 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.66■■■□□ 2.82
SEMA3B-202ENST00000418576 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.62■■■□□ 2.81
SEMA3B-202ENST00000418576 NESP48681 1621 aa32.6■■■□□ 2.81
SEMA3B-202ENST00000418576 CFTRP13569 1480 aa32.54■■■□□ 2.8
SEMA3B-202ENST00000418576 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.43■■■□□ 2.78
SEMA3B-202ENST00000418576 ERCC6Q03468 1493 aa32.37■■■□□ 2.77
SEMA3B-202ENST00000418576 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.26■■■□□ 2.75
SEMA3B-202ENST00000418576 PRDM2Q13029 1718 aa32.25■■■□□ 2.75
SEMA3B-202ENST00000418576 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.19■■■□□ 2.74
SEMA3B-202ENST00000418576 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.18■■■□□ 2.74
SEMA3B-202ENST00000418576 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.03■■■□□ 2.72
SEMA3B-202ENST00000418576 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
SEMA3B-202ENST00000418576 WDR62O43379 1518 aa31.88■■■□□ 2.69
SEMA3B-202ENST00000418576 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
SEMA3B-202ENST00000418576 ABCC8Q09428 1581 aa31.86■■■□□ 2.69
SEMA3B-202ENST00000418576 CUX2O14529 1486 aa31.82■■■□□ 2.68
SEMA3B-202ENST00000418576 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.78■■■□□ 2.68
SEMA3B-202ENST00000418576 TOPBP1Q92547 1522 aa31.78■■■□□ 2.68
SEMA3B-202ENST00000418576 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.72■■■□□ 2.67
SEMA3B-202ENST00000418576 CUX1P39880 1505 aa31.69■■■□□ 2.66
SEMA3B-202ENST00000418576 TOP2BQ02880 1626 aa31.56■■■□□ 2.64
SEMA3B-202ENST00000418576 SYNJ1O43426 1573 aa31.56■■■□□ 2.64
SEMA3B-202ENST00000418576 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
SEMA3B-202ENST00000418576 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.54■■■□□ 2.64
SEMA3B-202ENST00000418576 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.53■■■□□ 2.64
SEMA3B-202ENST00000418576 IFT140Q96RY7 1462 aa31.49■■■□□ 2.63
SEMA3B-202ENST00000418576 SOGA1O94964 1423 aa31.47■■■□□ 2.63
SEMA3B-202ENST00000418576 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.4■■■□□ 2.62
SEMA3B-202ENST00000418576 TRIM41Q8WV44 630 aa31.37■■■□□ 2.61
SEMA3B-202ENST00000418576 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
SEMA3B-202ENST00000418576 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
SEMA3B-202ENST00000418576 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.26■■■□□ 2.59
SEMA3B-202ENST00000418576 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.23■■■□□ 2.59
SEMA3B-202ENST00000418576 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
SEMA3B-202ENST00000418576 WDR97A6NE52 1622 aa31.18■■■□□ 2.58
SEMA3B-202ENST00000418576 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.18■■■□□ 2.581e-7■■■■□ 24.4
SEMA3B-202ENST00000418576 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
SEMA3B-202ENST00000418576 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.1■■■□□ 2.57
SEMA3B-202ENST00000418576 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.05■■■□□ 2.56
SEMA3B-202ENST00000418576 KIF27Q86VH2 1401 aa31.05■■■□□ 2.56
SEMA3B-202ENST00000418576 GRIN2BQ13224 1484 aa31.03■■■□□ 2.56
SEMA3B-202ENST00000418576 PBRM1Q86U86 1689 aa30.93■■■□□ 2.54
SEMA3B-202ENST00000418576 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.9■■■□□ 2.54
SEMA3B-202ENST00000418576 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.9■■■□□ 2.54
SEMA3B-202ENST00000418576 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
SEMA3B-202ENST00000418576 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.83■■■□□ 2.53
SEMA3B-202ENST00000418576 IGF1RP08069 1367 aa30.83■■■□□ 2.53
SEMA3B-202ENST00000418576 FBLN2P98095 1184 aa30.79■■■□□ 2.52
SEMA3B-202ENST00000418576 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
SEMA3B-202ENST00000418576 SYNJ2O15056 1496 aa30.77■■■□□ 2.52
SEMA3B-202ENST00000418576 EEA1Q15075 1411 aa30.77■■■□□ 2.52
SEMA3B-202ENST00000418576 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.76■■■□□ 2.51
SEMA3B-202ENST00000418576 ADAMTS12P58397 1594 aa30.73■■■□□ 2.51
SEMA3B-202ENST00000418576 CUL7Q14999 1698 aa30.7■■■□□ 2.51
SEMA3B-202ENST00000418576 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.69■■■□□ 2.5
SEMA3B-202ENST00000418576 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
SEMA3B-202ENST00000418576 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.68■■■□□ 2.5
SEMA3B-202ENST00000418576 OSCARQ8IYS5 282 aa30.66■■■□□ 2.5
SEMA3B-202ENST00000418576 CHD1O14646 1710 aa30.65■■■□□ 2.5
SEMA3B-202ENST00000418576 GRIN2AQ12879 1464 aa30.61■■■□□ 2.49
SEMA3B-202ENST00000418576 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.54■■■□□ 2.48
SEMA3B-202ENST00000418576 PRXQ9BXM0 1461 aa30.52■■■□□ 2.48
SEMA3B-202ENST00000418576 NUP160Q12769 1436 aa30.45■■■□□ 2.47
SEMA3B-202ENST00000418576 CEP170Q5SW79 1584 aa30.4■■■□□ 2.46
SEMA3B-202ENST00000418576 KIF21BO75037 1637 aa30.35■■■□□ 2.45
SEMA3B-202ENST00000418576 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.34■■■□□ 2.45
SEMA3B-202ENST00000418576 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.33■■■□□ 2.45
SEMA3B-202ENST00000418576 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.3■■■□□ 2.44
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