Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGY1

NOL12, Nucleolar protein 12, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL12Q9UGY1 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 300
NOL12Q9UGY1 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.29□□□□□ -0.281e-15■■■■■ 220.2
NOL12Q9UGY1 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt11.11□□□□□ -0.631e-15■■■■■ 220.2
NOL12Q9UGY1 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt11.08□□□□□ -0.641e-15■■■■■ 220.2
NOL12Q9UGY1 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)22.64■■□□□ 1.227e-44■■■■■ 137.4
NOL12Q9UGY1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.947e-44■■■■■ 137.4
NOL12Q9UGY1 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 220.18■□□□□ 0.827e-44■■■■■ 137.4
NOL12Q9UGY1 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 219.45■□□□□ 0.77e-44■■■■■ 137.4
NOL12Q9UGY1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.537e-44■■■■■ 137.4
NOL12Q9UGY1 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.037e-44■■■■■ 137.4
NOL12Q9UGY1 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.487e-44■■■■■ 137.4
NOL12Q9UGY1 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 38.93□□□□□ -0.987e-44■■■■■ 137.4
NOL12Q9UGY1 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 38.9□□□□□ -0.987e-44■■■■■ 137.4
NOL12Q9UGY1 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 58.9□□□□□ -0.987e-44■■■■■ 137.4
NOL12Q9UGY1 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 44.91□□□□□ -1.627e-44■■■■■ 137.4
NOL12Q9UGY1 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 53.79□□□□□ -1.87e-44■■■■■ 137.4
NOL12Q9UGY1 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 53.52□□□□□ -1.857e-44■■■■■ 137.4
NOL12Q9UGY1 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.43□□□□□ -2.187e-44■■■■■ 137.4
NOL12Q9UGY1 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.179e-10■■■■■ 124.9
NOL12Q9UGY1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.653e-10■■■■■ 121.7
NOL12Q9UGY1 LINC01344-203ENST00000608183 2631 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.814e-16■■■■■ 98.8
NOL12Q9UGY1 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.574e-16■■■■■ 98.8
NOL12Q9UGY1 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 93.2
NOL12Q9UGY1 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 58.07□□□□□ -1.129e-9■■■■■ 71.9
NOL12Q9UGY1 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 54.72□□□□□ -1.659e-9■■■■■ 71.9
NOL12Q9UGY1 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 54.33□□□□□ -1.729e-9■■■■■ 71.9
NOL12Q9UGY1 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 53.81□□□□□ -1.89e-9■■■■■ 71.9
NOL12Q9UGY1 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.19e-9■■■■■ 71.9
NOL12Q9UGY1 SLC6A8-203ENST00000429147 334 ntTSL 215.66■□□□□ 0.14e-11■■■■■ 68.7
NOL12Q9UGY1 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.072e-10■■■■■ 68.5
NOL12Q9UGY1 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.042e-10■■■■■ 68.5
NOL12Q9UGY1 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.032e-10■■■■■ 68.5
NOL12Q9UGY1 PID1-206ENST00000534952 553 ntTSL 413.89□□□□□ -0.192e-10■■■■■ 68.5
NOL12Q9UGY1 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.172e-10■■■■■ 68.5
NOL12Q9UGY1 PID1-205ENST00000482518 479 ntTSL 26.48□□□□□ -1.372e-10■■■■■ 68.5
NOL12Q9UGY1 FLVCR2-201ENST00000238667 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.217e-20■■■■■ 64.4
NOL12Q9UGY1 FLVCR2-205ENST00000554496 441 ntTSL 312.14□□□□□ -0.477e-20■■■■■ 64.4
NOL12Q9UGY1 FLVCR2-209ENST00000555385 218 ntTSL 48.4□□□□□ -1.067e-20■■■■■ 64.4
NOL12Q9UGY1 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.967e-20■■■■■ 64.4
NOL12Q9UGY1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.98■□□□□ 0.639e-10■■■■■ 60.1
NOL12Q9UGY1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.239e-10■■■■■ 60.1
NOL12Q9UGY1 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.219e-10■■■■■ 60.1
NOL12Q9UGY1 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.189e-10■■■■■ 60.1
NOL12Q9UGY1 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.181e-323■■■■■ 51.9
NOL12Q9UGY1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.412e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.072e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 ENOSF1-215ENST00000583771 436 ntTSL 520.91■□□□□ 0.942e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 ENOSF1-218ENST00000584453 1230 ntTSL 520.7■□□□□ 0.92e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 ENOSF1-210ENST00000581332 451 ntTSL 420.56■□□□□ 0.882e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.72e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.632e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 ENOSF1-211ENST00000581475 1745 ntTSL 1 (best)17.93■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 NUMA1-229ENST00000545721 2796 ntTSL 516.27■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.152e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -02e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.042e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 ENOSF1-206ENST00000578651 1177 ntTSL 214.74□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 NCAPH2-210ENST00000523045 970 ntTSL 514.61□□□□□ -0.072e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.082e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.082e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 NCAPH2-206ENST00000518394 720 ntTSL 513.17□□□□□ -0.32e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 NUMA1-220ENST00000541584 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.12□□□□□ -0.312e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 ENOSF1-207ENST00000579053 1313 ntTSL 513.04□□□□□ -0.322e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 NCAPH2-204ENST00000418794 640 ntTSL 512.5□□□□□ -0.412e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 ENOSF1-208ENST00000580605 699 ntTSL 311.89□□□□□ -0.512e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 ENOSF1-221ENST00000585004 1501 ntTSL 211.24□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 ENOSF1-222ENST00000585128 1296 ntTSL 510.83□□□□□ -0.682e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 NUMA1-201ENST00000351960 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 NUMA1-232ENST00000613205 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.882e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 NUMA1-230ENST00000546036 592 ntTSL 28.86□□□□□ -0.992e-8■■■■■ 51.5
NOL12Q9UGY1 CKB-206ENST00000553994 746 ntTSL 227.71■■■□□ 2.033e-8■■■■■ 50.5
NOL12Q9UGY1 CKB-205ENST00000553878 856 ntTSL 227.71■■■□□ 2.033e-8■■■■■ 50.5
NOL12Q9UGY1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.493e-8■■■■■ 50.5
NOL12Q9UGY1 CKB-208ENST00000554426 775 ntTSL 523.08■■□□□ 1.293e-8■■■■■ 50.5
NOL12Q9UGY1 CKB-214ENST00000555770 816 ntTSL 422.12■■□□□ 1.133e-8■■■■■ 50.5
NOL12Q9UGY1 CKB-209ENST00000554705 803 ntTSL 219.11■□□□□ 0.653e-8■■■■■ 50.5
NOL12Q9UGY1 CKB-204ENST00000553652 1239 ntTSL 517.91■□□□□ 0.463e-8■■■■■ 50.5
NOL12Q9UGY1 CKB-213ENST00000555659 755 ntTSL 217.08■□□□□ 0.323e-8■■■■■ 50.5
NOL12Q9UGY1 CKB-216ENST00000557530 523 ntTSL 413.04□□□□□ -0.323e-8■■■■■ 50.5
NOL12Q9UGY1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.541e-323■■■■■ 50
NOL12Q9UGY1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.471e-323■■■■■ 50
NOL12Q9UGY1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.411e-323■■■■■ 50
NOL12Q9UGY1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.281e-323■■■■■ 50
NOL12Q9UGY1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.281e-323■■■■■ 50
NOL12Q9UGY1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.21e-323■■■■■ 50
NOL12Q9UGY1 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.371e-323■■■■■ 50
NOL12Q9UGY1 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.371e-323■■■■■ 50
NOL12Q9UGY1 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2□□□□□ -2.091e-323■■■■■ 50
NOL12Q9UGY1 ABCA13-201ENST00000411975 4480 ntTSL 213.52□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 48.3
NOL12Q9UGY1 ABCA13-205ENST00000453246 4275 ntTSL 211.43□□□□□ -0.583e-7■■■■■ 48.3
NOL12Q9UGY1 ABCA13-207ENST00000544596 7870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.3□□□□□ -0.923e-7■■■■■ 48.3
NOL12Q9UGY1 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.453e-7■■■■■ 48.3
NOL12Q9UGY1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.81e-7■■■■■ 47.2
NOL12Q9UGY1 GREB1-209ENST00000472040 571 ntTSL 514.73□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 47.2
NOL12Q9UGY1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.16e-7■■■■■ 46.2
Retrieved 100 of 4,605 protein–RNA pairs in 33.2 ms