Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y9

LY96, Lymphocyte antigen 96, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY96Q9Y6Y9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LY96Q9Y6Y9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LY96Q9Y6Y9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LY96Q9Y6Y9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LY96Q9Y6Y9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LY96Q9Y6Y9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LY96Q9Y6Y9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LY96Q9Y6Y9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LY96Q9Y6Y9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LY96Q9Y6Y9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LY96Q9Y6Y9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LY96Q9Y6Y9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LY96Q9Y6Y9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LY96Q9Y6Y9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LY96Q9Y6Y9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LY96Q9Y6Y9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LY96Q9Y6Y9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LY96Q9Y6Y9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LY96Q9Y6Y9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LY96Q9Y6Y9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LY96Q9Y6Y9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LY96Q9Y6Y9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LY96Q9Y6Y9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LY96Q9Y6Y9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LY96Q9Y6Y9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LY96Q9Y6Y9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LY96Q9Y6Y9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LY96Q9Y6Y9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LY96Q9Y6Y9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LY96Q9Y6Y9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LY96Q9Y6Y9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LY96Q9Y6Y9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LY96Q9Y6Y9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LY96Q9Y6Y9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LY96Q9Y6Y9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LY96Q9Y6Y9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LY96Q9Y6Y9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LY96Q9Y6Y9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LY96Q9Y6Y9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LY96Q9Y6Y9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LY96Q9Y6Y9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LY96Q9Y6Y9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LY96Q9Y6Y9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LY96Q9Y6Y9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LY96Q9Y6Y9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LY96Q9Y6Y9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LY96Q9Y6Y9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LY96Q9Y6Y9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LY96Q9Y6Y9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LY96Q9Y6Y9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LY96Q9Y6Y9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LY96Q9Y6Y9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LY96Q9Y6Y9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LY96Q9Y6Y9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LY96Q9Y6Y9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LY96Q9Y6Y9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LY96Q9Y6Y9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LY96Q9Y6Y9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LY96Q9Y6Y9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LY96Q9Y6Y9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LY96Q9Y6Y9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LY96Q9Y6Y9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LY96Q9Y6Y9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LY96Q9Y6Y9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LY96Q9Y6Y9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LY96Q9Y6Y9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LY96Q9Y6Y9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LY96Q9Y6Y9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LY96Q9Y6Y9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LY96Q9Y6Y9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LY96Q9Y6Y9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LY96Q9Y6Y9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LY96Q9Y6Y9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LY96Q9Y6Y9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LY96Q9Y6Y9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LY96Q9Y6Y9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LY96Q9Y6Y9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LY96Q9Y6Y9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LY96Q9Y6Y9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LY96Q9Y6Y9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LY96Q9Y6Y9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
LY96Q9Y6Y9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LY96Q9Y6Y9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LY96Q9Y6Y9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LY96Q9Y6Y9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LY96Q9Y6Y9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LY96Q9Y6Y9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LY96Q9Y6Y9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LY96Q9Y6Y9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LY96Q9Y6Y9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LY96Q9Y6Y9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LY96Q9Y6Y9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LY96Q9Y6Y9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LY96Q9Y6Y9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LY96Q9Y6Y9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LY96Q9Y6Y9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LY96Q9Y6Y9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LY96Q9Y6Y9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LY96Q9Y6Y9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LY96Q9Y6Y9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms