Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E1

PCDHB9, Protocadherin beta-9, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB9Q9Y5E1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHB9Q9Y5E1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB9Q9Y5E1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB9Q9Y5E1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDHB9Q9Y5E1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHB9Q9Y5E1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHB9Q9Y5E1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHB9Q9Y5E1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PCDHB9Q9Y5E1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCDHB9Q9Y5E1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCDHB9Q9Y5E1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHB9Q9Y5E1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHB9Q9Y5E1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHB9Q9Y5E1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHB9Q9Y5E1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHB9Q9Y5E1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB9Q9Y5E1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHB9Q9Y5E1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDHB9Q9Y5E1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDHB9Q9Y5E1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDHB9Q9Y5E1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PCDHB9Q9Y5E1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHB9Q9Y5E1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCDHB9Q9Y5E1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHB9Q9Y5E1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHB9Q9Y5E1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHB9Q9Y5E1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHB9Q9Y5E1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHB9Q9Y5E1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB9Q9Y5E1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB9Q9Y5E1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB9Q9Y5E1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHB9Q9Y5E1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB9Q9Y5E1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB9Q9Y5E1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB9Q9Y5E1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHB9Q9Y5E1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHB9Q9Y5E1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB9Q9Y5E1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHB9Q9Y5E1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB9Q9Y5E1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB9Q9Y5E1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB9Q9Y5E1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB9Q9Y5E1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB9Q9Y5E1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PCDHB9Q9Y5E1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB9Q9Y5E1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB9Q9Y5E1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB9Q9Y5E1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB9Q9Y5E1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB9Q9Y5E1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB9Q9Y5E1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHB9Q9Y5E1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB9Q9Y5E1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB9Q9Y5E1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB9Q9Y5E1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB9Q9Y5E1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB9Q9Y5E1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB9Q9Y5E1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB9Q9Y5E1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB9Q9Y5E1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB9Q9Y5E1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB9Q9Y5E1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCDHB9Q9Y5E1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB9Q9Y5E1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB9Q9Y5E1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB9Q9Y5E1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB9Q9Y5E1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB9Q9Y5E1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB9Q9Y5E1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB9Q9Y5E1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB9Q9Y5E1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB9Q9Y5E1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB9Q9Y5E1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB9Q9Y5E1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB9Q9Y5E1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB9Q9Y5E1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB9Q9Y5E1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB9Q9Y5E1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB9Q9Y5E1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB9Q9Y5E1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB9Q9Y5E1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB9Q9Y5E1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB9Q9Y5E1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB9Q9Y5E1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB9Q9Y5E1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCDHB9Q9Y5E1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB9Q9Y5E1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB9Q9Y5E1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB9Q9Y5E1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB9Q9Y5E1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB9Q9Y5E1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB9Q9Y5E1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB9Q9Y5E1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB9Q9Y5E1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB9Q9Y5E1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB9Q9Y5E1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB9Q9Y5E1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB9Q9Y5E1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms