Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PAXBP1Q9Y5B6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PAXBP1Q9Y5B6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PAXBP1Q9Y5B6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PAXBP1Q9Y5B6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PAXBP1Q9Y5B6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PAXBP1Q9Y5B6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PAXBP1Q9Y5B6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PAXBP1Q9Y5B6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PAXBP1Q9Y5B6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PAXBP1Q9Y5B6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PAXBP1Q9Y5B6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PAXBP1Q9Y5B6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PAXBP1Q9Y5B6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PAXBP1Q9Y5B6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PAXBP1Q9Y5B6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PAXBP1Q9Y5B6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PAXBP1Q9Y5B6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PAXBP1Q9Y5B6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PAXBP1Q9Y5B6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PAXBP1Q9Y5B6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PAXBP1Q9Y5B6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PAXBP1Q9Y5B6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PAXBP1Q9Y5B6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PAXBP1Q9Y5B6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PAXBP1Q9Y5B6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PAXBP1Q9Y5B6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PAXBP1Q9Y5B6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PAXBP1Q9Y5B6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PAXBP1Q9Y5B6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PAXBP1Q9Y5B6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PAXBP1Q9Y5B6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PAXBP1Q9Y5B6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PAXBP1Q9Y5B6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PAXBP1Q9Y5B6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PAXBP1Q9Y5B6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PAXBP1Q9Y5B6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PAXBP1Q9Y5B6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PAXBP1Q9Y5B6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PAXBP1Q9Y5B6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PAXBP1Q9Y5B6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PAXBP1Q9Y5B6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PAXBP1Q9Y5B6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PAXBP1Q9Y5B6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PAXBP1Q9Y5B6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PAXBP1Q9Y5B6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PAXBP1Q9Y5B6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PAXBP1Q9Y5B6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PAXBP1Q9Y5B6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PAXBP1Q9Y5B6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PAXBP1Q9Y5B6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PAXBP1Q9Y5B6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PAXBP1Q9Y5B6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PAXBP1Q9Y5B6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PAXBP1Q9Y5B6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PAXBP1Q9Y5B6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PAXBP1Q9Y5B6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PAXBP1Q9Y5B6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PAXBP1Q9Y5B6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PAXBP1Q9Y5B6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PAXBP1Q9Y5B6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PAXBP1Q9Y5B6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PAXBP1Q9Y5B6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PAXBP1Q9Y5B6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PAXBP1Q9Y5B6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PAXBP1Q9Y5B6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PAXBP1Q9Y5B6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PAXBP1Q9Y5B6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PAXBP1Q9Y5B6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PAXBP1Q9Y5B6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PAXBP1Q9Y5B6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PAXBP1Q9Y5B6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PAXBP1Q9Y5B6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PAXBP1Q9Y5B6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PAXBP1Q9Y5B6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PAXBP1Q9Y5B6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PAXBP1Q9Y5B6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PAXBP1Q9Y5B6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PAXBP1Q9Y5B6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PAXBP1Q9Y5B6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PAXBP1Q9Y5B6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PAXBP1Q9Y5B6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PAXBP1Q9Y5B6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PAXBP1Q9Y5B6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PAXBP1Q9Y5B6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PAXBP1Q9Y5B6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PAXBP1Q9Y5B6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PAXBP1Q9Y5B6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PAXBP1Q9Y5B6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PAXBP1Q9Y5B6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PAXBP1Q9Y5B6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PAXBP1Q9Y5B6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms