Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TTLL3Q9Y4R7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTLL3Q9Y4R7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTLL3Q9Y4R7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTLL3Q9Y4R7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTLL3Q9Y4R7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TTLL3Q9Y4R7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTLL3Q9Y4R7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TTLL3Q9Y4R7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TTLL3Q9Y4R7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTLL3Q9Y4R7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TTLL3Q9Y4R7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TTLL3Q9Y4R7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TTLL3Q9Y4R7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TTLL3Q9Y4R7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TTLL3Q9Y4R7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL3Q9Y4R7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL3Q9Y4R7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL3Q9Y4R7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL3Q9Y4R7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL3Q9Y4R7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TTLL3Q9Y4R7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTLL3Q9Y4R7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTLL3Q9Y4R7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TTLL3Q9Y4R7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TTLL3Q9Y4R7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TTLL3Q9Y4R7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TTLL3Q9Y4R7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TTLL3Q9Y4R7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TTLL3Q9Y4R7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TTLL3Q9Y4R7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTLL3Q9Y4R7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTLL3Q9Y4R7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TTLL3Q9Y4R7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL3Q9Y4R7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TTLL3Q9Y4R7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TTLL3Q9Y4R7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTLL3Q9Y4R7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTLL3Q9Y4R7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTLL3Q9Y4R7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TTLL3Q9Y4R7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TTLL3Q9Y4R7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TTLL3Q9Y4R7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TTLL3Q9Y4R7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TTLL3Q9Y4R7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TTLL3Q9Y4R7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TTLL3Q9Y4R7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TTLL3Q9Y4R7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTLL3Q9Y4R7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTLL3Q9Y4R7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TTLL3Q9Y4R7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TTLL3Q9Y4R7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL3Q9Y4R7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL3Q9Y4R7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TTLL3Q9Y4R7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTLL3Q9Y4R7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTLL3Q9Y4R7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TTLL3Q9Y4R7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TTLL3Q9Y4R7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL3Q9Y4R7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL3Q9Y4R7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL3Q9Y4R7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TTLL3Q9Y4R7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTLL3Q9Y4R7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TTLL3Q9Y4R7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTLL3Q9Y4R7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL3Q9Y4R7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL3Q9Y4R7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL3Q9Y4R7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTLL3Q9Y4R7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTLL3Q9Y4R7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTLL3Q9Y4R7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTLL3Q9Y4R7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTLL3Q9Y4R7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTLL3Q9Y4R7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTLL3Q9Y4R7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTLL3Q9Y4R7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL3Q9Y4R7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTLL3Q9Y4R7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTLL3Q9Y4R7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL3Q9Y4R7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL3Q9Y4R7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL3Q9Y4R7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL3Q9Y4R7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTLL3Q9Y4R7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTLL3Q9Y4R7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTLL3Q9Y4R7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTLL3Q9Y4R7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTLL3Q9Y4R7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL3Q9Y4R7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL3Q9Y4R7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTLL3Q9Y4R7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTLL3Q9Y4R7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TTLL3Q9Y4R7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTLL3Q9Y4R7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTLL3Q9Y4R7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTLL3Q9Y4R7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTLL3Q9Y4R7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTLL3Q9Y4R7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTLL3Q9Y4R7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms