Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SNX24Q9Y343 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX24Q9Y343 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX24Q9Y343 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SNX24Q9Y343 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNX24Q9Y343 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX24Q9Y343 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX24Q9Y343 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX24Q9Y343 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX24Q9Y343 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX24Q9Y343 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNX24Q9Y343 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNX24Q9Y343 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX24Q9Y343 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX24Q9Y343 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX24Q9Y343 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX24Q9Y343 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX24Q9Y343 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX24Q9Y343 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX24Q9Y343 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX24Q9Y343 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX24Q9Y343 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX24Q9Y343 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNX24Q9Y343 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNX24Q9Y343 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNX24Q9Y343 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNX24Q9Y343 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNX24Q9Y343 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNX24Q9Y343 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNX24Q9Y343 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNX24Q9Y343 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX24Q9Y343 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX24Q9Y343 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX24Q9Y343 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX24Q9Y343 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNX24Q9Y343 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNX24Q9Y343 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX24Q9Y343 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNX24Q9Y343 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SNX24Q9Y343 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX24Q9Y343 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNX24Q9Y343 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNX24Q9Y343 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SNX24Q9Y343 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNX24Q9Y343 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SNX24Q9Y343 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SNX24Q9Y343 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX24Q9Y343 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX24Q9Y343 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX24Q9Y343 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX24Q9Y343 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX24Q9Y343 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SNX24Q9Y343 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX24Q9Y343 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX24Q9Y343 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX24Q9Y343 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX24Q9Y343 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX24Q9Y343 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX24Q9Y343 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX24Q9Y343 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX24Q9Y343 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX24Q9Y343 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX24Q9Y343 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX24Q9Y343 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX24Q9Y343 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX24Q9Y343 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX24Q9Y343 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX24Q9Y343 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX24Q9Y343 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNX24Q9Y343 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX24Q9Y343 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX24Q9Y343 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX24Q9Y343 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX24Q9Y343 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX24Q9Y343 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNX24Q9Y343 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX24Q9Y343 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX24Q9Y343 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX24Q9Y343 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX24Q9Y343 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX24Q9Y343 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX24Q9Y343 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNX24Q9Y343 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX24Q9Y343 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX24Q9Y343 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX24Q9Y343 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX24Q9Y343 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SNX24Q9Y343 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX24Q9Y343 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX24Q9Y343 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX24Q9Y343 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX24Q9Y343 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX24Q9Y343 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX24Q9Y343 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX24Q9Y343 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNX24Q9Y343 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX24Q9Y343 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX24Q9Y343 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX24Q9Y343 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SNX24Q9Y343 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms