Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPR55Q9Y2T6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPR55Q9Y2T6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPR55Q9Y2T6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPR55Q9Y2T6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPR55Q9Y2T6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPR55Q9Y2T6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPR55Q9Y2T6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPR55Q9Y2T6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPR55Q9Y2T6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPR55Q9Y2T6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPR55Q9Y2T6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPR55Q9Y2T6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPR55Q9Y2T6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPR55Q9Y2T6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPR55Q9Y2T6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPR55Q9Y2T6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPR55Q9Y2T6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPR55Q9Y2T6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPR55Q9Y2T6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPR55Q9Y2T6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GPR55Q9Y2T6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPR55Q9Y2T6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPR55Q9Y2T6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPR55Q9Y2T6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GPR55Q9Y2T6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPR55Q9Y2T6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GPR55Q9Y2T6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPR55Q9Y2T6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPR55Q9Y2T6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPR55Q9Y2T6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GPR55Q9Y2T6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GPR55Q9Y2T6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPR55Q9Y2T6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GPR55Q9Y2T6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPR55Q9Y2T6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPR55Q9Y2T6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPR55Q9Y2T6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPR55Q9Y2T6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPR55Q9Y2T6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPR55Q9Y2T6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPR55Q9Y2T6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPR55Q9Y2T6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPR55Q9Y2T6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPR55Q9Y2T6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPR55Q9Y2T6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPR55Q9Y2T6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPR55Q9Y2T6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPR55Q9Y2T6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPR55Q9Y2T6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPR55Q9Y2T6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPR55Q9Y2T6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPR55Q9Y2T6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPR55Q9Y2T6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPR55Q9Y2T6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPR55Q9Y2T6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPR55Q9Y2T6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPR55Q9Y2T6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPR55Q9Y2T6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPR55Q9Y2T6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPR55Q9Y2T6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPR55Q9Y2T6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPR55Q9Y2T6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPR55Q9Y2T6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPR55Q9Y2T6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPR55Q9Y2T6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPR55Q9Y2T6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPR55Q9Y2T6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPR55Q9Y2T6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPR55Q9Y2T6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPR55Q9Y2T6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPR55Q9Y2T6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPR55Q9Y2T6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GPR55Q9Y2T6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPR55Q9Y2T6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPR55Q9Y2T6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPR55Q9Y2T6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPR55Q9Y2T6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPR55Q9Y2T6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPR55Q9Y2T6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPR55Q9Y2T6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPR55Q9Y2T6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPR55Q9Y2T6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GPR55Q9Y2T6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPR55Q9Y2T6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPR55Q9Y2T6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPR55Q9Y2T6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPR55Q9Y2T6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPR55Q9Y2T6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPR55Q9Y2T6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPR55Q9Y2T6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPR55Q9Y2T6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPR55Q9Y2T6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPR55Q9Y2T6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GPR55Q9Y2T6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPR55Q9Y2T6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPR55Q9Y2T6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPR55Q9Y2T6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPR55Q9Y2T6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPR55Q9Y2T6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms