Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PIKFYVEQ9Y2I7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIKFYVEQ9Y2I7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PIKFYVEQ9Y2I7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIKFYVEQ9Y2I7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PIKFYVEQ9Y2I7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIKFYVEQ9Y2I7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PIKFYVEQ9Y2I7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PIKFYVEQ9Y2I7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIKFYVEQ9Y2I7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PIKFYVEQ9Y2I7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PIKFYVEQ9Y2I7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIKFYVEQ9Y2I7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PIKFYVEQ9Y2I7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIKFYVEQ9Y2I7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIKFYVEQ9Y2I7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIKFYVEQ9Y2I7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIKFYVEQ9Y2I7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIKFYVEQ9Y2I7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIKFYVEQ9Y2I7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIKFYVEQ9Y2I7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIKFYVEQ9Y2I7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIKFYVEQ9Y2I7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIKFYVEQ9Y2I7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIKFYVEQ9Y2I7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIKFYVEQ9Y2I7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIKFYVEQ9Y2I7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIKFYVEQ9Y2I7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIKFYVEQ9Y2I7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIKFYVEQ9Y2I7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIKFYVEQ9Y2I7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PIKFYVEQ9Y2I7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIKFYVEQ9Y2I7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIKFYVEQ9Y2I7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIKFYVEQ9Y2I7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIKFYVEQ9Y2I7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIKFYVEQ9Y2I7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIKFYVEQ9Y2I7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIKFYVEQ9Y2I7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIKFYVEQ9Y2I7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIKFYVEQ9Y2I7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIKFYVEQ9Y2I7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIKFYVEQ9Y2I7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIKFYVEQ9Y2I7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIKFYVEQ9Y2I7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PIKFYVEQ9Y2I7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIKFYVEQ9Y2I7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PIKFYVEQ9Y2I7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PIKFYVEQ9Y2I7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PIKFYVEQ9Y2I7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PIKFYVEQ9Y2I7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PIKFYVEQ9Y2I7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PIKFYVEQ9Y2I7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PIKFYVEQ9Y2I7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PIKFYVEQ9Y2I7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PIKFYVEQ9Y2I7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PIKFYVEQ9Y2I7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PIKFYVEQ9Y2I7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PIKFYVEQ9Y2I7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PIKFYVEQ9Y2I7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIKFYVEQ9Y2I7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PIKFYVEQ9Y2I7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIKFYVEQ9Y2I7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIKFYVEQ9Y2I7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIKFYVEQ9Y2I7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIKFYVEQ9Y2I7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PIKFYVEQ9Y2I7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIKFYVEQ9Y2I7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PIKFYVEQ9Y2I7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIKFYVEQ9Y2I7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PIKFYVEQ9Y2I7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIKFYVEQ9Y2I7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PIKFYVEQ9Y2I7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PIKFYVEQ9Y2I7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PIKFYVEQ9Y2I7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIKFYVEQ9Y2I7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIKFYVEQ9Y2I7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PIKFYVEQ9Y2I7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PIKFYVEQ9Y2I7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PIKFYVEQ9Y2I7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PIKFYVEQ9Y2I7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PIKFYVEQ9Y2I7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIKFYVEQ9Y2I7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PIKFYVEQ9Y2I7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIKFYVEQ9Y2I7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIKFYVEQ9Y2I7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PIKFYVEQ9Y2I7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIKFYVEQ9Y2I7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PIKFYVEQ9Y2I7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIKFYVEQ9Y2I7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIKFYVEQ9Y2I7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PIKFYVEQ9Y2I7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms