Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF223Q9UK11 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF223Q9UK11 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF223Q9UK11 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF223Q9UK11 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF223Q9UK11 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF223Q9UK11 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF223Q9UK11 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF223Q9UK11 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF223Q9UK11 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF223Q9UK11 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF223Q9UK11 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF223Q9UK11 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF223Q9UK11 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF223Q9UK11 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF223Q9UK11 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF223Q9UK11 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF223Q9UK11 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF223Q9UK11 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF223Q9UK11 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF223Q9UK11 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF223Q9UK11 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF223Q9UK11 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF223Q9UK11 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF223Q9UK11 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF223Q9UK11 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF223Q9UK11 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF223Q9UK11 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF223Q9UK11 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF223Q9UK11 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF223Q9UK11 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF223Q9UK11 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF223Q9UK11 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF223Q9UK11 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF223Q9UK11 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF223Q9UK11 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF223Q9UK11 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF223Q9UK11 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF223Q9UK11 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF223Q9UK11 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF223Q9UK11 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF223Q9UK11 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF223Q9UK11 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF223Q9UK11 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF223Q9UK11 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF223Q9UK11 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF223Q9UK11 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF223Q9UK11 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF223Q9UK11 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF223Q9UK11 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF223Q9UK11 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF223Q9UK11 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF223Q9UK11 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF223Q9UK11 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF223Q9UK11 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF223Q9UK11 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF223Q9UK11 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF223Q9UK11 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF223Q9UK11 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF223Q9UK11 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF223Q9UK11 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF223Q9UK11 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF223Q9UK11 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF223Q9UK11 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF223Q9UK11 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF223Q9UK11 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF223Q9UK11 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF223Q9UK11 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF223Q9UK11 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF223Q9UK11 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF223Q9UK11 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF223Q9UK11 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF223Q9UK11 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF223Q9UK11 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF223Q9UK11 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF223Q9UK11 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF223Q9UK11 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF223Q9UK11 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF223Q9UK11 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF223Q9UK11 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF223Q9UK11 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF223Q9UK11 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF223Q9UK11 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF223Q9UK11 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF223Q9UK11 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF223Q9UK11 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF223Q9UK11 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF223Q9UK11 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF223Q9UK11 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF223Q9UK11 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF223Q9UK11 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF223Q9UK11 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF223Q9UK11 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF223Q9UK11 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF223Q9UK11 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF223Q9UK11 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF223Q9UK11 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF223Q9UK11 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF223Q9UK11 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF223Q9UK11 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms