Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
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RABGEF1Q9UJ41 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABGEF1Q9UJ41 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RABGEF1Q9UJ41 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RABGEF1Q9UJ41 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RABGEF1Q9UJ41 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RABGEF1Q9UJ41 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RABGEF1Q9UJ41 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RABGEF1Q9UJ41 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RABGEF1Q9UJ41 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RABGEF1Q9UJ41 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RABGEF1Q9UJ41 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RABGEF1Q9UJ41 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RABGEF1Q9UJ41 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RABGEF1Q9UJ41 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RABGEF1Q9UJ41 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RABGEF1Q9UJ41 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RABGEF1Q9UJ41 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RABGEF1Q9UJ41 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RABGEF1Q9UJ41 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RABGEF1Q9UJ41 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RABGEF1Q9UJ41 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RABGEF1Q9UJ41 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RABGEF1Q9UJ41 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RABGEF1Q9UJ41 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RABGEF1Q9UJ41 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RABGEF1Q9UJ41 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RABGEF1Q9UJ41 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RABGEF1Q9UJ41 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RABGEF1Q9UJ41 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RABGEF1Q9UJ41 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RABGEF1Q9UJ41 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABGEF1Q9UJ41 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RABGEF1Q9UJ41 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RABGEF1Q9UJ41 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RABGEF1Q9UJ41 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RABGEF1Q9UJ41 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RABGEF1Q9UJ41 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABGEF1Q9UJ41 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABGEF1Q9UJ41 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABGEF1Q9UJ41 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABGEF1Q9UJ41 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RABGEF1Q9UJ41 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABGEF1Q9UJ41 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABGEF1Q9UJ41 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABGEF1Q9UJ41 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RABGEF1Q9UJ41 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RABGEF1Q9UJ41 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RABGEF1Q9UJ41 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RABGEF1Q9UJ41 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RABGEF1Q9UJ41 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RABGEF1Q9UJ41 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RABGEF1Q9UJ41 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RABGEF1Q9UJ41 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RABGEF1Q9UJ41 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RABGEF1Q9UJ41 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RABGEF1Q9UJ41 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RABGEF1Q9UJ41 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RABGEF1Q9UJ41 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABGEF1Q9UJ41 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RABGEF1Q9UJ41 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
RABGEF1Q9UJ41 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RABGEF1Q9UJ41 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RABGEF1Q9UJ41 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RABGEF1Q9UJ41 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RABGEF1Q9UJ41 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RABGEF1Q9UJ41 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RABGEF1Q9UJ41 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RABGEF1Q9UJ41 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RABGEF1Q9UJ41 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RABGEF1Q9UJ41 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RABGEF1Q9UJ41 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
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RABGEF1Q9UJ41 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RABGEF1Q9UJ41 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RABGEF1Q9UJ41 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABGEF1Q9UJ41 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RABGEF1Q9UJ41 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABGEF1Q9UJ41 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RABGEF1Q9UJ41 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RABGEF1Q9UJ41 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RABGEF1Q9UJ41 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RABGEF1Q9UJ41 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RABGEF1Q9UJ41 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RABGEF1Q9UJ41 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RABGEF1Q9UJ41 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RABGEF1Q9UJ41 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RABGEF1Q9UJ41 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RABGEF1Q9UJ41 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RABGEF1Q9UJ41 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RABGEF1Q9UJ41 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RABGEF1Q9UJ41 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RABGEF1Q9UJ41 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABGEF1Q9UJ41 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RABGEF1Q9UJ41 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RABGEF1Q9UJ41 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RABGEF1Q9UJ41 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
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