Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV9

PFDN2, Prefoldin subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN2Q9UHV9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFDN2Q9UHV9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN2Q9UHV9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFDN2Q9UHV9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFDN2Q9UHV9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFDN2Q9UHV9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFDN2Q9UHV9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFDN2Q9UHV9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFDN2Q9UHV9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFDN2Q9UHV9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFDN2Q9UHV9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFDN2Q9UHV9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFDN2Q9UHV9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFDN2Q9UHV9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFDN2Q9UHV9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFDN2Q9UHV9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFDN2Q9UHV9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFDN2Q9UHV9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFDN2Q9UHV9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFDN2Q9UHV9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PFDN2Q9UHV9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFDN2Q9UHV9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFDN2Q9UHV9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFDN2Q9UHV9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFDN2Q9UHV9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFDN2Q9UHV9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFDN2Q9UHV9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFDN2Q9UHV9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PFDN2Q9UHV9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PFDN2Q9UHV9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PFDN2Q9UHV9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PFDN2Q9UHV9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PFDN2Q9UHV9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PFDN2Q9UHV9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PFDN2Q9UHV9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PFDN2Q9UHV9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PFDN2Q9UHV9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PFDN2Q9UHV9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PFDN2Q9UHV9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PFDN2Q9UHV9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN2Q9UHV9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PFDN2Q9UHV9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN2Q9UHV9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PFDN2Q9UHV9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN2Q9UHV9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PFDN2Q9UHV9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN2Q9UHV9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PFDN2Q9UHV9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN2Q9UHV9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN2Q9UHV9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PFDN2Q9UHV9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PFDN2Q9UHV9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PFDN2Q9UHV9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PFDN2Q9UHV9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN2Q9UHV9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PFDN2Q9UHV9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFDN2Q9UHV9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PFDN2Q9UHV9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN2Q9UHV9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN2Q9UHV9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFDN2Q9UHV9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN2Q9UHV9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN2Q9UHV9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFDN2Q9UHV9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PFDN2Q9UHV9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PFDN2Q9UHV9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PFDN2Q9UHV9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN2Q9UHV9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN2Q9UHV9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFDN2Q9UHV9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFDN2Q9UHV9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN2Q9UHV9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFDN2Q9UHV9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFDN2Q9UHV9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN2Q9UHV9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN2Q9UHV9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFDN2Q9UHV9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PFDN2Q9UHV9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFDN2Q9UHV9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN2Q9UHV9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFDN2Q9UHV9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN2Q9UHV9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN2Q9UHV9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN2Q9UHV9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN2Q9UHV9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN2Q9UHV9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN2Q9UHV9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN2Q9UHV9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN2Q9UHV9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN2Q9UHV9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN2Q9UHV9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN2Q9UHV9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN2Q9UHV9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN2Q9UHV9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN2Q9UHV9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN2Q9UHV9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN2Q9UHV9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PFDN2Q9UHV9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN2Q9UHV9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PFDN2Q9UHV9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms