Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPXQ9UHP9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPXQ9UHP9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMPXQ9UHP9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPXQ9UHP9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPXQ9UHP9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPXQ9UHP9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPXQ9UHP9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPXQ9UHP9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMPXQ9UHP9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMPXQ9UHP9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMPXQ9UHP9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMPXQ9UHP9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMPXQ9UHP9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPXQ9UHP9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMPXQ9UHP9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPXQ9UHP9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPXQ9UHP9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMPXQ9UHP9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPXQ9UHP9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMPXQ9UHP9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPXQ9UHP9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMPXQ9UHP9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPXQ9UHP9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMPXQ9UHP9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMPXQ9UHP9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPXQ9UHP9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPXQ9UHP9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPXQ9UHP9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMPXQ9UHP9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPXQ9UHP9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPXQ9UHP9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMPXQ9UHP9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPXQ9UHP9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMPXQ9UHP9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMPXQ9UHP9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMPXQ9UHP9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMPXQ9UHP9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPXQ9UHP9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPXQ9UHP9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPXQ9UHP9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMPXQ9UHP9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPXQ9UHP9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPXQ9UHP9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPXQ9UHP9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMPXQ9UHP9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMPXQ9UHP9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPXQ9UHP9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPXQ9UHP9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMPXQ9UHP9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMPXQ9UHP9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPXQ9UHP9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPXQ9UHP9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMPXQ9UHP9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPXQ9UHP9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPXQ9UHP9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMPXQ9UHP9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMPXQ9UHP9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMPXQ9UHP9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMPXQ9UHP9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMPXQ9UHP9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMPXQ9UHP9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMPXQ9UHP9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMPXQ9UHP9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPXQ9UHP9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMPXQ9UHP9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPXQ9UHP9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPXQ9UHP9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPXQ9UHP9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMPXQ9UHP9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMPXQ9UHP9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMPXQ9UHP9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPXQ9UHP9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMPXQ9UHP9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMPXQ9UHP9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SMPXQ9UHP9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMPXQ9UHP9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMPXQ9UHP9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms