Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY5

LPAR3, Lysophosphatidic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR3Q9UBY5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LPAR3Q9UBY5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LPAR3Q9UBY5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LPAR3Q9UBY5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LPAR3Q9UBY5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LPAR3Q9UBY5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LPAR3Q9UBY5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LPAR3Q9UBY5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LPAR3Q9UBY5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LPAR3Q9UBY5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LPAR3Q9UBY5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LPAR3Q9UBY5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LPAR3Q9UBY5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LPAR3Q9UBY5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LPAR3Q9UBY5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LPAR3Q9UBY5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LPAR3Q9UBY5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LPAR3Q9UBY5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPAR3Q9UBY5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPAR3Q9UBY5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPAR3Q9UBY5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPAR3Q9UBY5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LPAR3Q9UBY5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPAR3Q9UBY5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LPAR3Q9UBY5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LPAR3Q9UBY5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPAR3Q9UBY5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPAR3Q9UBY5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPAR3Q9UBY5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LPAR3Q9UBY5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPAR3Q9UBY5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LPAR3Q9UBY5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPAR3Q9UBY5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LPAR3Q9UBY5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LPAR3Q9UBY5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPAR3Q9UBY5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LPAR3Q9UBY5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPAR3Q9UBY5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPAR3Q9UBY5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPAR3Q9UBY5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPAR3Q9UBY5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPAR3Q9UBY5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPAR3Q9UBY5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPAR3Q9UBY5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPAR3Q9UBY5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPAR3Q9UBY5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPAR3Q9UBY5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPAR3Q9UBY5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPAR3Q9UBY5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPAR3Q9UBY5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPAR3Q9UBY5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPAR3Q9UBY5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPAR3Q9UBY5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPAR3Q9UBY5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPAR3Q9UBY5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPAR3Q9UBY5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPAR3Q9UBY5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPAR3Q9UBY5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPAR3Q9UBY5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPAR3Q9UBY5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPAR3Q9UBY5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPAR3Q9UBY5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPAR3Q9UBY5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPAR3Q9UBY5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPAR3Q9UBY5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPAR3Q9UBY5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPAR3Q9UBY5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPAR3Q9UBY5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LPAR3Q9UBY5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LPAR3Q9UBY5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LPAR3Q9UBY5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPAR3Q9UBY5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LPAR3Q9UBY5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LPAR3Q9UBY5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPAR3Q9UBY5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPAR3Q9UBY5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPAR3Q9UBY5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LPAR3Q9UBY5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPAR3Q9UBY5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LPAR3Q9UBY5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LPAR3Q9UBY5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LPAR3Q9UBY5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LPAR3Q9UBY5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LPAR3Q9UBY5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPAR3Q9UBY5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LPAR3Q9UBY5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPAR3Q9UBY5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPAR3Q9UBY5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LPAR3Q9UBY5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPAR3Q9UBY5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPAR3Q9UBY5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LPAR3Q9UBY5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LPAR3Q9UBY5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPAR3Q9UBY5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPAR3Q9UBY5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LPAR3Q9UBY5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LPAR3Q9UBY5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LPAR3Q9UBY5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LPAR3Q9UBY5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LPAR3Q9UBY5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.5 ms