Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFRSF10DQ9UBN6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFRSF10DQ9UBN6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFRSF10DQ9UBN6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFRSF10DQ9UBN6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFRSF10DQ9UBN6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFRSF10DQ9UBN6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF10DQ9UBN6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF10DQ9UBN6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFRSF10DQ9UBN6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFRSF10DQ9UBN6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFRSF10DQ9UBN6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFRSF10DQ9UBN6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFRSF10DQ9UBN6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF10DQ9UBN6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFRSF10DQ9UBN6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFRSF10DQ9UBN6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFRSF10DQ9UBN6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFRSF10DQ9UBN6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFRSF10DQ9UBN6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFRSF10DQ9UBN6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF10DQ9UBN6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFRSF10DQ9UBN6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFRSF10DQ9UBN6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFRSF10DQ9UBN6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFRSF10DQ9UBN6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFRSF10DQ9UBN6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFRSF10DQ9UBN6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF10DQ9UBN6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNFRSF10DQ9UBN6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF10DQ9UBN6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNFRSF10DQ9UBN6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNFRSF10DQ9UBN6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF10DQ9UBN6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF10DQ9UBN6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF10DQ9UBN6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNFRSF10DQ9UBN6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF10DQ9UBN6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNFRSF10DQ9UBN6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNFRSF10DQ9UBN6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF10DQ9UBN6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TNFRSF10DQ9UBN6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF10DQ9UBN6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF10DQ9UBN6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF10DQ9UBN6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNFRSF10DQ9UBN6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNFRSF10DQ9UBN6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNFRSF10DQ9UBN6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF10DQ9UBN6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF10DQ9UBN6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF10DQ9UBN6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF10DQ9UBN6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF10DQ9UBN6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF10DQ9UBN6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF10DQ9UBN6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF10DQ9UBN6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF10DQ9UBN6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF10DQ9UBN6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF10DQ9UBN6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF10DQ9UBN6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFRSF10DQ9UBN6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF10DQ9UBN6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF10DQ9UBN6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF10DQ9UBN6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF10DQ9UBN6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF10DQ9UBN6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFRSF10DQ9UBN6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF10DQ9UBN6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF10DQ9UBN6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFRSF10DQ9UBN6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF10DQ9UBN6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFRSF10DQ9UBN6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF10DQ9UBN6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF10DQ9UBN6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFRSF10DQ9UBN6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF10DQ9UBN6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFRSF10DQ9UBN6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF10DQ9UBN6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF10DQ9UBN6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFRSF10DQ9UBN6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF10DQ9UBN6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF10DQ9UBN6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF10DQ9UBN6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF10DQ9UBN6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNFRSF10DQ9UBN6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF10DQ9UBN6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF10DQ9UBN6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF10DQ9UBN6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF10DQ9UBN6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF10DQ9UBN6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF10DQ9UBN6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF10DQ9UBN6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF10DQ9UBN6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFRSF10DQ9UBN6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TNFRSF10DQ9UBN6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF10DQ9UBN6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFRSF10DQ9UBN6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFRSF10DQ9UBN6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms