Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLKQ9UBE8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NLKQ9UBE8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLKQ9UBE8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLKQ9UBE8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLKQ9UBE8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLKQ9UBE8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLKQ9UBE8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLKQ9UBE8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLKQ9UBE8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLKQ9UBE8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLKQ9UBE8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLKQ9UBE8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLKQ9UBE8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLKQ9UBE8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NLKQ9UBE8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLKQ9UBE8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLKQ9UBE8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLKQ9UBE8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLKQ9UBE8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLKQ9UBE8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLKQ9UBE8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLKQ9UBE8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLKQ9UBE8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NLKQ9UBE8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLKQ9UBE8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLKQ9UBE8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLKQ9UBE8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NLKQ9UBE8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLKQ9UBE8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLKQ9UBE8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NLKQ9UBE8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLKQ9UBE8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLKQ9UBE8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLKQ9UBE8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLKQ9UBE8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLKQ9UBE8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLKQ9UBE8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLKQ9UBE8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLKQ9UBE8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLKQ9UBE8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLKQ9UBE8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLKQ9UBE8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLKQ9UBE8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLKQ9UBE8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLKQ9UBE8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLKQ9UBE8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLKQ9UBE8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLKQ9UBE8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NLKQ9UBE8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLKQ9UBE8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLKQ9UBE8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLKQ9UBE8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLKQ9UBE8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLKQ9UBE8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLKQ9UBE8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLKQ9UBE8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLKQ9UBE8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLKQ9UBE8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLKQ9UBE8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NLKQ9UBE8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLKQ9UBE8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NLKQ9UBE8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLKQ9UBE8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NLKQ9UBE8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLKQ9UBE8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NLKQ9UBE8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLKQ9UBE8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLKQ9UBE8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NLKQ9UBE8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLKQ9UBE8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NLKQ9UBE8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NLKQ9UBE8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NLKQ9UBE8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLKQ9UBE8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLKQ9UBE8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLKQ9UBE8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NLKQ9UBE8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLKQ9UBE8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLKQ9UBE8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLKQ9UBE8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLKQ9UBE8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NLKQ9UBE8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLKQ9UBE8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLKQ9UBE8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLKQ9UBE8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NLKQ9UBE8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NLKQ9UBE8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLKQ9UBE8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NLKQ9UBE8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLKQ9UBE8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NLKQ9UBE8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NLKQ9UBE8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NLKQ9UBE8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NLKQ9UBE8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLKQ9UBE8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NLKQ9UBE8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLKQ9UBE8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NLKQ9UBE8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLKQ9UBE8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms