Protein–RNA interactions for Protein: Q9P086

MED11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED11Q9P086 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED11Q9P086 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED11Q9P086 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED11Q9P086 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED11Q9P086 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED11Q9P086 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED11Q9P086 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MED11Q9P086 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED11Q9P086 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED11Q9P086 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED11Q9P086 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED11Q9P086 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED11Q9P086 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED11Q9P086 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED11Q9P086 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED11Q9P086 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED11Q9P086 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED11Q9P086 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED11Q9P086 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED11Q9P086 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED11Q9P086 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED11Q9P086 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MED11Q9P086 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED11Q9P086 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED11Q9P086 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED11Q9P086 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED11Q9P086 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED11Q9P086 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED11Q9P086 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED11Q9P086 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED11Q9P086 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED11Q9P086 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED11Q9P086 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED11Q9P086 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED11Q9P086 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED11Q9P086 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED11Q9P086 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MED11Q9P086 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED11Q9P086 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED11Q9P086 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MED11Q9P086 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MED11Q9P086 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED11Q9P086 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED11Q9P086 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED11Q9P086 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED11Q9P086 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MED11Q9P086 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MED11Q9P086 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED11Q9P086 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED11Q9P086 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED11Q9P086 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED11Q9P086 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED11Q9P086 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED11Q9P086 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED11Q9P086 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED11Q9P086 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED11Q9P086 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MED11Q9P086 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED11Q9P086 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED11Q9P086 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MED11Q9P086 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MED11Q9P086 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MED11Q9P086 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MED11Q9P086 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MED11Q9P086 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED11Q9P086 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MED11Q9P086 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED11Q9P086 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED11Q9P086 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MED11Q9P086 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MED11Q9P086 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MED11Q9P086 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MED11Q9P086 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MED11Q9P086 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MED11Q9P086 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MED11Q9P086 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MED11Q9P086 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MED11Q9P086 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MED11Q9P086 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED11Q9P086 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED11Q9P086 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MED11Q9P086 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MED11Q9P086 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MED11Q9P086 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MED11Q9P086 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MED11Q9P086 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MED11Q9P086 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED11Q9P086 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED11Q9P086 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED11Q9P086 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED11Q9P086 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED11Q9P086 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED11Q9P086 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED11Q9P086 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED11Q9P086 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED11Q9P086 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED11Q9P086 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED11Q9P086 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED11Q9P086 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MED11Q9P086 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms