Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDL2Q9NX52 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDL2Q9NX52 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDL2Q9NX52 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDL2Q9NX52 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDL2Q9NX52 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDL2Q9NX52 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RHBDL2Q9NX52 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDL2Q9NX52 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDL2Q9NX52 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDL2Q9NX52 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDL2Q9NX52 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDL2Q9NX52 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHBDL2Q9NX52 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDL2Q9NX52 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RHBDL2Q9NX52 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDL2Q9NX52 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDL2Q9NX52 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDL2Q9NX52 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHBDL2Q9NX52 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHBDL2Q9NX52 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDL2Q9NX52 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDL2Q9NX52 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHBDL2Q9NX52 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHBDL2Q9NX52 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDL2Q9NX52 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHBDL2Q9NX52 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHBDL2Q9NX52 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHBDL2Q9NX52 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RHBDL2Q9NX52 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDL2Q9NX52 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHBDL2Q9NX52 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHBDL2Q9NX52 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHBDL2Q9NX52 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHBDL2Q9NX52 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RHBDL2Q9NX52 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHBDL2Q9NX52 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHBDL2Q9NX52 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHBDL2Q9NX52 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHBDL2Q9NX52 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL2Q9NX52 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL2Q9NX52 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL2Q9NX52 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL2Q9NX52 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHBDL2Q9NX52 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDL2Q9NX52 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDL2Q9NX52 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDL2Q9NX52 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDL2Q9NX52 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL2Q9NX52 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL2Q9NX52 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL2Q9NX52 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL2Q9NX52 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDL2Q9NX52 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDL2Q9NX52 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RHBDL2Q9NX52 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDL2Q9NX52 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDL2Q9NX52 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDL2Q9NX52 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDL2Q9NX52 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDL2Q9NX52 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDL2Q9NX52 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDL2Q9NX52 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDL2Q9NX52 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDL2Q9NX52 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDL2Q9NX52 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDL2Q9NX52 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDL2Q9NX52 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDL2Q9NX52 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDL2Q9NX52 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDL2Q9NX52 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDL2Q9NX52 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDL2Q9NX52 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDL2Q9NX52 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDL2Q9NX52 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDL2Q9NX52 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDL2Q9NX52 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDL2Q9NX52 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDL2Q9NX52 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDL2Q9NX52 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDL2Q9NX52 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDL2Q9NX52 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDL2Q9NX52 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDL2Q9NX52 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDL2Q9NX52 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDL2Q9NX52 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDL2Q9NX52 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDL2Q9NX52 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDL2Q9NX52 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDL2Q9NX52 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDL2Q9NX52 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDL2Q9NX52 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDL2Q9NX52 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDL2Q9NX52 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RHBDL2Q9NX52 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RHBDL2Q9NX52 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RHBDL2Q9NX52 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDL2Q9NX52 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RHBDL2Q9NX52 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms