Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PAPOLBQ9NRJ5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAPOLBQ9NRJ5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PAPOLBQ9NRJ5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PAPOLBQ9NRJ5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAPOLBQ9NRJ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAPOLBQ9NRJ5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAPOLBQ9NRJ5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PAPOLBQ9NRJ5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PAPOLBQ9NRJ5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PAPOLBQ9NRJ5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PAPOLBQ9NRJ5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PAPOLBQ9NRJ5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PAPOLBQ9NRJ5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPOLBQ9NRJ5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPOLBQ9NRJ5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PAPOLBQ9NRJ5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPOLBQ9NRJ5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PAPOLBQ9NRJ5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPOLBQ9NRJ5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPOLBQ9NRJ5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PAPOLBQ9NRJ5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPOLBQ9NRJ5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PAPOLBQ9NRJ5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAPOLBQ9NRJ5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PAPOLBQ9NRJ5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAPOLBQ9NRJ5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAPOLBQ9NRJ5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAPOLBQ9NRJ5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PAPOLBQ9NRJ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAPOLBQ9NRJ5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PAPOLBQ9NRJ5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAPOLBQ9NRJ5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAPOLBQ9NRJ5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAPOLBQ9NRJ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAPOLBQ9NRJ5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAPOLBQ9NRJ5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAPOLBQ9NRJ5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAPOLBQ9NRJ5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAPOLBQ9NRJ5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAPOLBQ9NRJ5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAPOLBQ9NRJ5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAPOLBQ9NRJ5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAPOLBQ9NRJ5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAPOLBQ9NRJ5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAPOLBQ9NRJ5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAPOLBQ9NRJ5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAPOLBQ9NRJ5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAPOLBQ9NRJ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAPOLBQ9NRJ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAPOLBQ9NRJ5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAPOLBQ9NRJ5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAPOLBQ9NRJ5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAPOLBQ9NRJ5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAPOLBQ9NRJ5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAPOLBQ9NRJ5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAPOLBQ9NRJ5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAPOLBQ9NRJ5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAPOLBQ9NRJ5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAPOLBQ9NRJ5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAPOLBQ9NRJ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PAPOLBQ9NRJ5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAPOLBQ9NRJ5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PAPOLBQ9NRJ5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PAPOLBQ9NRJ5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAPOLBQ9NRJ5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAPOLBQ9NRJ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PAPOLBQ9NRJ5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAPOLBQ9NRJ5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAPOLBQ9NRJ5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PAPOLBQ9NRJ5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAPOLBQ9NRJ5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PAPOLBQ9NRJ5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAPOLBQ9NRJ5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAPOLBQ9NRJ5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PAPOLBQ9NRJ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAPOLBQ9NRJ5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAPOLBQ9NRJ5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PAPOLBQ9NRJ5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PAPOLBQ9NRJ5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PAPOLBQ9NRJ5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PAPOLBQ9NRJ5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPOLBQ9NRJ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPOLBQ9NRJ5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPOLBQ9NRJ5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PAPOLBQ9NRJ5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PAPOLBQ9NRJ5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PAPOLBQ9NRJ5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAPOLBQ9NRJ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PAPOLBQ9NRJ5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAPOLBQ9NRJ5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PAPOLBQ9NRJ5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PAPOLBQ9NRJ5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAPOLBQ9NRJ5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PAPOLBQ9NRJ5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms