Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH2

SNRK, SNF-related serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRKQ9NRH2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SNRKQ9NRH2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SNRKQ9NRH2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SNRKQ9NRH2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SNRKQ9NRH2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SNRKQ9NRH2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SNRKQ9NRH2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SNRKQ9NRH2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SNRKQ9NRH2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
SNRKQ9NRH2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SNRKQ9NRH2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SNRKQ9NRH2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SNRKQ9NRH2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNRKQ9NRH2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SNRKQ9NRH2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SNRKQ9NRH2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SNRKQ9NRH2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
SNRKQ9NRH2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SNRKQ9NRH2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNRKQ9NRH2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SNRKQ9NRH2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNRKQ9NRH2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNRKQ9NRH2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNRKQ9NRH2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SNRKQ9NRH2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SNRKQ9NRH2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SNRKQ9NRH2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SNRKQ9NRH2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SNRKQ9NRH2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SNRKQ9NRH2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SNRKQ9NRH2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SNRKQ9NRH2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
SNRKQ9NRH2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SNRKQ9NRH2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SNRKQ9NRH2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SNRKQ9NRH2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SNRKQ9NRH2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SNRKQ9NRH2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
SNRKQ9NRH2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SNRKQ9NRH2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SNRKQ9NRH2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SNRKQ9NRH2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SNRKQ9NRH2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SNRKQ9NRH2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SNRKQ9NRH2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SNRKQ9NRH2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SNRKQ9NRH2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SNRKQ9NRH2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SNRKQ9NRH2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SNRKQ9NRH2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SNRKQ9NRH2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SNRKQ9NRH2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SNRKQ9NRH2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SNRKQ9NRH2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SNRKQ9NRH2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SNRKQ9NRH2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
SNRKQ9NRH2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SNRKQ9NRH2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
SNRKQ9NRH2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SNRKQ9NRH2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SNRKQ9NRH2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SNRKQ9NRH2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SNRKQ9NRH2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SNRKQ9NRH2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SNRKQ9NRH2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SNRKQ9NRH2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SNRKQ9NRH2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SNRKQ9NRH2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SNRKQ9NRH2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SNRKQ9NRH2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SNRKQ9NRH2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SNRKQ9NRH2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SNRKQ9NRH2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SNRKQ9NRH2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SNRKQ9NRH2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SNRKQ9NRH2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SNRKQ9NRH2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SNRKQ9NRH2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SNRKQ9NRH2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SNRKQ9NRH2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SNRKQ9NRH2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNRKQ9NRH2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SNRKQ9NRH2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNRKQ9NRH2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNRKQ9NRH2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SNRKQ9NRH2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SNRKQ9NRH2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SNRKQ9NRH2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SNRKQ9NRH2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SNRKQ9NRH2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SNRKQ9NRH2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SNRKQ9NRH2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SNRKQ9NRH2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SNRKQ9NRH2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SNRKQ9NRH2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SNRKQ9NRH2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SNRKQ9NRH2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SNRKQ9NRH2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SNRKQ9NRH2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SNRKQ9NRH2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1136.3 ms