Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX5

NPDC1, Neural proliferation differentiation and control protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPDC1Q9NQX5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPDC1Q9NQX5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPDC1Q9NQX5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NPDC1Q9NQX5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPDC1Q9NQX5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPDC1Q9NQX5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPDC1Q9NQX5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPDC1Q9NQX5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPDC1Q9NQX5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPDC1Q9NQX5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPDC1Q9NQX5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPDC1Q9NQX5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPDC1Q9NQX5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPDC1Q9NQX5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPDC1Q9NQX5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPDC1Q9NQX5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPDC1Q9NQX5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPDC1Q9NQX5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPDC1Q9NQX5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPDC1Q9NQX5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPDC1Q9NQX5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPDC1Q9NQX5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NPDC1Q9NQX5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPDC1Q9NQX5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPDC1Q9NQX5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPDC1Q9NQX5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NPDC1Q9NQX5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPDC1Q9NQX5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPDC1Q9NQX5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPDC1Q9NQX5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPDC1Q9NQX5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPDC1Q9NQX5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPDC1Q9NQX5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPDC1Q9NQX5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NPDC1Q9NQX5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPDC1Q9NQX5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPDC1Q9NQX5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPDC1Q9NQX5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPDC1Q9NQX5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPDC1Q9NQX5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPDC1Q9NQX5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPDC1Q9NQX5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPDC1Q9NQX5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPDC1Q9NQX5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NPDC1Q9NQX5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPDC1Q9NQX5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPDC1Q9NQX5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPDC1Q9NQX5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPDC1Q9NQX5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPDC1Q9NQX5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPDC1Q9NQX5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NPDC1Q9NQX5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPDC1Q9NQX5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPDC1Q9NQX5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPDC1Q9NQX5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NPDC1Q9NQX5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPDC1Q9NQX5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NPDC1Q9NQX5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPDC1Q9NQX5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPDC1Q9NQX5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPDC1Q9NQX5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPDC1Q9NQX5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPDC1Q9NQX5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NPDC1Q9NQX5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NPDC1Q9NQX5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPDC1Q9NQX5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPDC1Q9NQX5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPDC1Q9NQX5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPDC1Q9NQX5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPDC1Q9NQX5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPDC1Q9NQX5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPDC1Q9NQX5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPDC1Q9NQX5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPDC1Q9NQX5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPDC1Q9NQX5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPDC1Q9NQX5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPDC1Q9NQX5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPDC1Q9NQX5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPDC1Q9NQX5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPDC1Q9NQX5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPDC1Q9NQX5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPDC1Q9NQX5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NPDC1Q9NQX5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPDC1Q9NQX5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPDC1Q9NQX5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPDC1Q9NQX5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPDC1Q9NQX5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPDC1Q9NQX5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPDC1Q9NQX5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPDC1Q9NQX5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPDC1Q9NQX5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPDC1Q9NQX5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPDC1Q9NQX5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPDC1Q9NQX5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPDC1Q9NQX5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPDC1Q9NQX5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPDC1Q9NQX5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPDC1Q9NQX5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPDC1Q9NQX5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPDC1Q9NQX5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms