Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCRT2Q9NQ03 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SCRT2Q9NQ03 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCRT2Q9NQ03 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCRT2Q9NQ03 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCRT2Q9NQ03 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCRT2Q9NQ03 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCRT2Q9NQ03 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCRT2Q9NQ03 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCRT2Q9NQ03 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCRT2Q9NQ03 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCRT2Q9NQ03 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCRT2Q9NQ03 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCRT2Q9NQ03 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCRT2Q9NQ03 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCRT2Q9NQ03 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCRT2Q9NQ03 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCRT2Q9NQ03 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCRT2Q9NQ03 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCRT2Q9NQ03 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCRT2Q9NQ03 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCRT2Q9NQ03 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCRT2Q9NQ03 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCRT2Q9NQ03 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCRT2Q9NQ03 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCRT2Q9NQ03 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCRT2Q9NQ03 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCRT2Q9NQ03 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCRT2Q9NQ03 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCRT2Q9NQ03 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCRT2Q9NQ03 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCRT2Q9NQ03 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCRT2Q9NQ03 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCRT2Q9NQ03 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCRT2Q9NQ03 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCRT2Q9NQ03 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCRT2Q9NQ03 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCRT2Q9NQ03 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCRT2Q9NQ03 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCRT2Q9NQ03 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCRT2Q9NQ03 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCRT2Q9NQ03 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCRT2Q9NQ03 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCRT2Q9NQ03 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCRT2Q9NQ03 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCRT2Q9NQ03 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCRT2Q9NQ03 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SCRT2Q9NQ03 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCRT2Q9NQ03 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SCRT2Q9NQ03 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCRT2Q9NQ03 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SCRT2Q9NQ03 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SCRT2Q9NQ03 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SCRT2Q9NQ03 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCRT2Q9NQ03 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCRT2Q9NQ03 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCRT2Q9NQ03 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCRT2Q9NQ03 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCRT2Q9NQ03 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCRT2Q9NQ03 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCRT2Q9NQ03 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCRT2Q9NQ03 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCRT2Q9NQ03 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SCRT2Q9NQ03 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCRT2Q9NQ03 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCRT2Q9NQ03 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCRT2Q9NQ03 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCRT2Q9NQ03 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCRT2Q9NQ03 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCRT2Q9NQ03 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCRT2Q9NQ03 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCRT2Q9NQ03 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCRT2Q9NQ03 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCRT2Q9NQ03 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCRT2Q9NQ03 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SCRT2Q9NQ03 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCRT2Q9NQ03 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCRT2Q9NQ03 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCRT2Q9NQ03 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCRT2Q9NQ03 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCRT2Q9NQ03 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCRT2Q9NQ03 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCRT2Q9NQ03 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCRT2Q9NQ03 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCRT2Q9NQ03 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCRT2Q9NQ03 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCRT2Q9NQ03 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCRT2Q9NQ03 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCRT2Q9NQ03 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCRT2Q9NQ03 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCRT2Q9NQ03 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCRT2Q9NQ03 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCRT2Q9NQ03 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCRT2Q9NQ03 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCRT2Q9NQ03 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCRT2Q9NQ03 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCRT2Q9NQ03 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCRT2Q9NQ03 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRT2Q9NQ03 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCRT2Q9NQ03 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms