Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRCC1Q9NPI7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRCC1Q9NPI7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRCC1Q9NPI7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRCC1Q9NPI7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRCC1Q9NPI7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRCC1Q9NPI7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRCC1Q9NPI7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRCC1Q9NPI7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KRCC1Q9NPI7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRCC1Q9NPI7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRCC1Q9NPI7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRCC1Q9NPI7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRCC1Q9NPI7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRCC1Q9NPI7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRCC1Q9NPI7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRCC1Q9NPI7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRCC1Q9NPI7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRCC1Q9NPI7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRCC1Q9NPI7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRCC1Q9NPI7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRCC1Q9NPI7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRCC1Q9NPI7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRCC1Q9NPI7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRCC1Q9NPI7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRCC1Q9NPI7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRCC1Q9NPI7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRCC1Q9NPI7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRCC1Q9NPI7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRCC1Q9NPI7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRCC1Q9NPI7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRCC1Q9NPI7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRCC1Q9NPI7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRCC1Q9NPI7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRCC1Q9NPI7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRCC1Q9NPI7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRCC1Q9NPI7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRCC1Q9NPI7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRCC1Q9NPI7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRCC1Q9NPI7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRCC1Q9NPI7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRCC1Q9NPI7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRCC1Q9NPI7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRCC1Q9NPI7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRCC1Q9NPI7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRCC1Q9NPI7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRCC1Q9NPI7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRCC1Q9NPI7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRCC1Q9NPI7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRCC1Q9NPI7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRCC1Q9NPI7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRCC1Q9NPI7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRCC1Q9NPI7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRCC1Q9NPI7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KRCC1Q9NPI7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRCC1Q9NPI7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRCC1Q9NPI7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRCC1Q9NPI7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRCC1Q9NPI7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KRCC1Q9NPI7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRCC1Q9NPI7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KRCC1Q9NPI7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRCC1Q9NPI7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRCC1Q9NPI7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRCC1Q9NPI7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRCC1Q9NPI7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRCC1Q9NPI7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRCC1Q9NPI7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRCC1Q9NPI7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRCC1Q9NPI7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRCC1Q9NPI7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRCC1Q9NPI7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRCC1Q9NPI7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRCC1Q9NPI7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRCC1Q9NPI7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRCC1Q9NPI7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRCC1Q9NPI7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRCC1Q9NPI7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRCC1Q9NPI7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRCC1Q9NPI7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRCC1Q9NPI7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRCC1Q9NPI7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRCC1Q9NPI7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRCC1Q9NPI7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRCC1Q9NPI7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRCC1Q9NPI7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRCC1Q9NPI7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRCC1Q9NPI7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRCC1Q9NPI7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRCC1Q9NPI7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRCC1Q9NPI7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRCC1Q9NPI7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRCC1Q9NPI7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRCC1Q9NPI7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRCC1Q9NPI7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KRCC1Q9NPI7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRCC1Q9NPI7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRCC1Q9NPI7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KRCC1Q9NPI7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KRCC1Q9NPI7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms