Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ABCB6Q9NP58 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ABCB6Q9NP58 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ABCB6Q9NP58 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCB6Q9NP58 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ABCB6Q9NP58 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCB6Q9NP58 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCB6Q9NP58 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCB6Q9NP58 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ABCB6Q9NP58 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ABCB6Q9NP58 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ABCB6Q9NP58 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ABCB6Q9NP58 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ABCB6Q9NP58 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ABCB6Q9NP58 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ABCB6Q9NP58 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ABCB6Q9NP58 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ABCB6Q9NP58 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ABCB6Q9NP58 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ABCB6Q9NP58 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ABCB6Q9NP58 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ABCB6Q9NP58 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCB6Q9NP58 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCB6Q9NP58 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCB6Q9NP58 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCB6Q9NP58 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCB6Q9NP58 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCB6Q9NP58 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCB6Q9NP58 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCB6Q9NP58 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCB6Q9NP58 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCB6Q9NP58 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCB6Q9NP58 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCB6Q9NP58 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCB6Q9NP58 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCB6Q9NP58 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCB6Q9NP58 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCB6Q9NP58 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABCB6Q9NP58 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ABCB6Q9NP58 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ABCB6Q9NP58 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABCB6Q9NP58 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCB6Q9NP58 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCB6Q9NP58 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCB6Q9NP58 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCB6Q9NP58 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCB6Q9NP58 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCB6Q9NP58 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCB6Q9NP58 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCB6Q9NP58 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCB6Q9NP58 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCB6Q9NP58 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCB6Q9NP58 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCB6Q9NP58 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCB6Q9NP58 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCB6Q9NP58 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ABCB6Q9NP58 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCB6Q9NP58 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCB6Q9NP58 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCB6Q9NP58 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ABCB6Q9NP58 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCB6Q9NP58 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCB6Q9NP58 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCB6Q9NP58 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCB6Q9NP58 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCB6Q9NP58 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCB6Q9NP58 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCB6Q9NP58 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCB6Q9NP58 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ABCB6Q9NP58 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCB6Q9NP58 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCB6Q9NP58 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ABCB6Q9NP58 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ABCB6Q9NP58 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCB6Q9NP58 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ABCB6Q9NP58 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
ABCB6Q9NP58 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCB6Q9NP58 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCB6Q9NP58 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCB6Q9NP58 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCB6Q9NP58 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ABCB6Q9NP58 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCB6Q9NP58 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ABCB6Q9NP58 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCB6Q9NP58 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCB6Q9NP58 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ABCB6Q9NP58 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ABCB6Q9NP58 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ABCB6Q9NP58 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ABCB6Q9NP58 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCB6Q9NP58 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ABCB6Q9NP58 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCB6Q9NP58 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCB6Q9NP58 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCB6Q9NP58 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ABCB6Q9NP58 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCB6Q9NP58 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCB6Q9NP58 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCB6Q9NP58 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ABCB6Q9NP58 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 644.7 ms