Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN4

GPN1, GPN-loop GTPase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN1Q9HCN4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPN1Q9HCN4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPN1Q9HCN4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPN1Q9HCN4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPN1Q9HCN4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPN1Q9HCN4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPN1Q9HCN4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPN1Q9HCN4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPN1Q9HCN4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPN1Q9HCN4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPN1Q9HCN4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPN1Q9HCN4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GPN1Q9HCN4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPN1Q9HCN4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPN1Q9HCN4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GPN1Q9HCN4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPN1Q9HCN4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPN1Q9HCN4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPN1Q9HCN4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPN1Q9HCN4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPN1Q9HCN4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPN1Q9HCN4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPN1Q9HCN4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPN1Q9HCN4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPN1Q9HCN4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPN1Q9HCN4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPN1Q9HCN4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPN1Q9HCN4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPN1Q9HCN4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPN1Q9HCN4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPN1Q9HCN4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPN1Q9HCN4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPN1Q9HCN4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPN1Q9HCN4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPN1Q9HCN4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPN1Q9HCN4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPN1Q9HCN4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPN1Q9HCN4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPN1Q9HCN4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPN1Q9HCN4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPN1Q9HCN4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPN1Q9HCN4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPN1Q9HCN4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPN1Q9HCN4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPN1Q9HCN4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPN1Q9HCN4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPN1Q9HCN4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPN1Q9HCN4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPN1Q9HCN4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPN1Q9HCN4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPN1Q9HCN4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPN1Q9HCN4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPN1Q9HCN4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPN1Q9HCN4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPN1Q9HCN4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPN1Q9HCN4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPN1Q9HCN4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPN1Q9HCN4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPN1Q9HCN4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPN1Q9HCN4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPN1Q9HCN4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPN1Q9HCN4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPN1Q9HCN4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPN1Q9HCN4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPN1Q9HCN4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPN1Q9HCN4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPN1Q9HCN4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GPN1Q9HCN4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPN1Q9HCN4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPN1Q9HCN4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPN1Q9HCN4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPN1Q9HCN4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPN1Q9HCN4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPN1Q9HCN4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPN1Q9HCN4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPN1Q9HCN4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPN1Q9HCN4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPN1Q9HCN4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPN1Q9HCN4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPN1Q9HCN4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPN1Q9HCN4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPN1Q9HCN4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
GPN1Q9HCN4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPN1Q9HCN4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPN1Q9HCN4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPN1Q9HCN4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPN1Q9HCN4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPN1Q9HCN4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPN1Q9HCN4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPN1Q9HCN4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPN1Q9HCN4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPN1Q9HCN4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPN1Q9HCN4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPN1Q9HCN4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPN1Q9HCN4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPN1Q9HCN4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPN1Q9HCN4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPN1Q9HCN4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPN1Q9HCN4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GPN1Q9HCN4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.1 ms