Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEBOXQ9HB31 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEBOXQ9HB31 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEBOXQ9HB31 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEBOXQ9HB31 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEBOXQ9HB31 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEBOXQ9HB31 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEBOXQ9HB31 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEBOXQ9HB31 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEBOXQ9HB31 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEBOXQ9HB31 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEBOXQ9HB31 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEBOXQ9HB31 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SEBOXQ9HB31 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEBOXQ9HB31 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEBOXQ9HB31 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEBOXQ9HB31 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEBOXQ9HB31 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEBOXQ9HB31 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEBOXQ9HB31 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEBOXQ9HB31 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEBOXQ9HB31 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEBOXQ9HB31 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEBOXQ9HB31 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEBOXQ9HB31 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEBOXQ9HB31 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEBOXQ9HB31 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEBOXQ9HB31 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEBOXQ9HB31 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEBOXQ9HB31 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEBOXQ9HB31 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEBOXQ9HB31 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEBOXQ9HB31 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEBOXQ9HB31 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEBOXQ9HB31 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEBOXQ9HB31 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEBOXQ9HB31 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEBOXQ9HB31 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEBOXQ9HB31 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEBOXQ9HB31 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEBOXQ9HB31 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEBOXQ9HB31 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEBOXQ9HB31 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEBOXQ9HB31 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SEBOXQ9HB31 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEBOXQ9HB31 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEBOXQ9HB31 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEBOXQ9HB31 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEBOXQ9HB31 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEBOXQ9HB31 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEBOXQ9HB31 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEBOXQ9HB31 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEBOXQ9HB31 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEBOXQ9HB31 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEBOXQ9HB31 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEBOXQ9HB31 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEBOXQ9HB31 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEBOXQ9HB31 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEBOXQ9HB31 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEBOXQ9HB31 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEBOXQ9HB31 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEBOXQ9HB31 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEBOXQ9HB31 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEBOXQ9HB31 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEBOXQ9HB31 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEBOXQ9HB31 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEBOXQ9HB31 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEBOXQ9HB31 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEBOXQ9HB31 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEBOXQ9HB31 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEBOXQ9HB31 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEBOXQ9HB31 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEBOXQ9HB31 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEBOXQ9HB31 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEBOXQ9HB31 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEBOXQ9HB31 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEBOXQ9HB31 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEBOXQ9HB31 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEBOXQ9HB31 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEBOXQ9HB31 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEBOXQ9HB31 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEBOXQ9HB31 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEBOXQ9HB31 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEBOXQ9HB31 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEBOXQ9HB31 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEBOXQ9HB31 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEBOXQ9HB31 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEBOXQ9HB31 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEBOXQ9HB31 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEBOXQ9HB31 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEBOXQ9HB31 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEBOXQ9HB31 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEBOXQ9HB31 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEBOXQ9HB31 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEBOXQ9HB31 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEBOXQ9HB31 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEBOXQ9HB31 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEBOXQ9HB31 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEBOXQ9HB31 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEBOXQ9HB31 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms