Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLK4Q9HAZ1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLK4Q9HAZ1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLK4Q9HAZ1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLK4Q9HAZ1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLK4Q9HAZ1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLK4Q9HAZ1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLK4Q9HAZ1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLK4Q9HAZ1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLK4Q9HAZ1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLK4Q9HAZ1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLK4Q9HAZ1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLK4Q9HAZ1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLK4Q9HAZ1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLK4Q9HAZ1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLK4Q9HAZ1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CLK4Q9HAZ1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CLK4Q9HAZ1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLK4Q9HAZ1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLK4Q9HAZ1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLK4Q9HAZ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLK4Q9HAZ1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLK4Q9HAZ1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLK4Q9HAZ1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLK4Q9HAZ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLK4Q9HAZ1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLK4Q9HAZ1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLK4Q9HAZ1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLK4Q9HAZ1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLK4Q9HAZ1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLK4Q9HAZ1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLK4Q9HAZ1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLK4Q9HAZ1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLK4Q9HAZ1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLK4Q9HAZ1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLK4Q9HAZ1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLK4Q9HAZ1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLK4Q9HAZ1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLK4Q9HAZ1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLK4Q9HAZ1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLK4Q9HAZ1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLK4Q9HAZ1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLK4Q9HAZ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLK4Q9HAZ1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLK4Q9HAZ1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLK4Q9HAZ1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLK4Q9HAZ1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLK4Q9HAZ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLK4Q9HAZ1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLK4Q9HAZ1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLK4Q9HAZ1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLK4Q9HAZ1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLK4Q9HAZ1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLK4Q9HAZ1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLK4Q9HAZ1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLK4Q9HAZ1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLK4Q9HAZ1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLK4Q9HAZ1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLK4Q9HAZ1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLK4Q9HAZ1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLK4Q9HAZ1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLK4Q9HAZ1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLK4Q9HAZ1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLK4Q9HAZ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLK4Q9HAZ1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLK4Q9HAZ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLK4Q9HAZ1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLK4Q9HAZ1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLK4Q9HAZ1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLK4Q9HAZ1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLK4Q9HAZ1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CLK4Q9HAZ1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLK4Q9HAZ1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLK4Q9HAZ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLK4Q9HAZ1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLK4Q9HAZ1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLK4Q9HAZ1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLK4Q9HAZ1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLK4Q9HAZ1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLK4Q9HAZ1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLK4Q9HAZ1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLK4Q9HAZ1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLK4Q9HAZ1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLK4Q9HAZ1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLK4Q9HAZ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLK4Q9HAZ1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLK4Q9HAZ1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLK4Q9HAZ1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLK4Q9HAZ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLK4Q9HAZ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLK4Q9HAZ1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLK4Q9HAZ1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLK4Q9HAZ1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLK4Q9HAZ1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CLK4Q9HAZ1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLK4Q9HAZ1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLK4Q9HAZ1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLK4Q9HAZ1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLK4Q9HAZ1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLK4Q9HAZ1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms