Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LIN28AQ9H9Z2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LIN28AQ9H9Z2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIN28AQ9H9Z2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LIN28AQ9H9Z2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LIN28AQ9H9Z2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LIN28AQ9H9Z2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LIN28AQ9H9Z2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LIN28AQ9H9Z2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LIN28AQ9H9Z2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LIN28AQ9H9Z2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LIN28AQ9H9Z2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LIN28AQ9H9Z2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LIN28AQ9H9Z2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LIN28AQ9H9Z2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LIN28AQ9H9Z2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LIN28AQ9H9Z2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LIN28AQ9H9Z2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIN28AQ9H9Z2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIN28AQ9H9Z2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIN28AQ9H9Z2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIN28AQ9H9Z2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LIN28AQ9H9Z2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LIN28AQ9H9Z2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LIN28AQ9H9Z2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LIN28AQ9H9Z2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIN28AQ9H9Z2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LIN28AQ9H9Z2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LIN28AQ9H9Z2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LIN28AQ9H9Z2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LIN28AQ9H9Z2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LIN28AQ9H9Z2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LIN28AQ9H9Z2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LIN28AQ9H9Z2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LIN28AQ9H9Z2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LIN28AQ9H9Z2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LIN28AQ9H9Z2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LIN28AQ9H9Z2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LIN28AQ9H9Z2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LIN28AQ9H9Z2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LIN28AQ9H9Z2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LIN28AQ9H9Z2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LIN28AQ9H9Z2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LIN28AQ9H9Z2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LIN28AQ9H9Z2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LIN28AQ9H9Z2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LIN28AQ9H9Z2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LIN28AQ9H9Z2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LIN28AQ9H9Z2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LIN28AQ9H9Z2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LIN28AQ9H9Z2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LIN28AQ9H9Z2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LIN28AQ9H9Z2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LIN28AQ9H9Z2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIN28AQ9H9Z2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LIN28AQ9H9Z2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LIN28AQ9H9Z2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIN28AQ9H9Z2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIN28AQ9H9Z2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIN28AQ9H9Z2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIN28AQ9H9Z2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIN28AQ9H9Z2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIN28AQ9H9Z2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIN28AQ9H9Z2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIN28AQ9H9Z2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIN28AQ9H9Z2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIN28AQ9H9Z2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIN28AQ9H9Z2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIN28AQ9H9Z2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIN28AQ9H9Z2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIN28AQ9H9Z2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIN28AQ9H9Z2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIN28AQ9H9Z2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIN28AQ9H9Z2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIN28AQ9H9Z2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LIN28AQ9H9Z2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIN28AQ9H9Z2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LIN28AQ9H9Z2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIN28AQ9H9Z2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIN28AQ9H9Z2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIN28AQ9H9Z2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIN28AQ9H9Z2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIN28AQ9H9Z2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIN28AQ9H9Z2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LIN28AQ9H9Z2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LIN28AQ9H9Z2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LIN28AQ9H9Z2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIN28AQ9H9Z2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIN28AQ9H9Z2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIN28AQ9H9Z2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIN28AQ9H9Z2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIN28AQ9H9Z2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIN28AQ9H9Z2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIN28AQ9H9Z2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIN28AQ9H9Z2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIN28AQ9H9Z2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIN28AQ9H9Z2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms