Protein–RNA interactions for Protein: Q9H853

TUBA4B, Putative tubulin-like protein alpha-4B, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4BQ9H853 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA4BQ9H853 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA4BQ9H853 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA4BQ9H853 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA4BQ9H853 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA4BQ9H853 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA4BQ9H853 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA4BQ9H853 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA4BQ9H853 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA4BQ9H853 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA4BQ9H853 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA4BQ9H853 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA4BQ9H853 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA4BQ9H853 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA4BQ9H853 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA4BQ9H853 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA4BQ9H853 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA4BQ9H853 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA4BQ9H853 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA4BQ9H853 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA4BQ9H853 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA4BQ9H853 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA4BQ9H853 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA4BQ9H853 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBA4BQ9H853 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBA4BQ9H853 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBA4BQ9H853 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBA4BQ9H853 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA4BQ9H853 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBA4BQ9H853 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA4BQ9H853 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA4BQ9H853 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBA4BQ9H853 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA4BQ9H853 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBA4BQ9H853 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA4BQ9H853 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA4BQ9H853 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA4BQ9H853 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA4BQ9H853 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA4BQ9H853 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA4BQ9H853 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUBA4BQ9H853 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA4BQ9H853 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA4BQ9H853 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA4BQ9H853 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA4BQ9H853 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA4BQ9H853 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA4BQ9H853 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA4BQ9H853 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA4BQ9H853 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA4BQ9H853 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA4BQ9H853 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA4BQ9H853 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBA4BQ9H853 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA4BQ9H853 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBA4BQ9H853 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBA4BQ9H853 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBA4BQ9H853 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBA4BQ9H853 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA4BQ9H853 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA4BQ9H853 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBA4BQ9H853 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TUBA4BQ9H853 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA4BQ9H853 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TUBA4BQ9H853 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA4BQ9H853 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA4BQ9H853 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA4BQ9H853 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA4BQ9H853 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA4BQ9H853 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA4BQ9H853 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA4BQ9H853 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA4BQ9H853 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA4BQ9H853 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA4BQ9H853 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA4BQ9H853 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA4BQ9H853 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA4BQ9H853 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA4BQ9H853 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA4BQ9H853 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA4BQ9H853 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA4BQ9H853 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA4BQ9H853 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA4BQ9H853 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA4BQ9H853 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA4BQ9H853 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA4BQ9H853 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA4BQ9H853 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA4BQ9H853 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA4BQ9H853 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA4BQ9H853 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA4BQ9H853 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA4BQ9H853 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA4BQ9H853 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA4BQ9H853 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA4BQ9H853 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA4BQ9H853 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA4BQ9H853 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA4BQ9H853 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA4BQ9H853 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms