Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTR3CQ9C0K3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTR3CQ9C0K3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR3CQ9C0K3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTR3CQ9C0K3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR3CQ9C0K3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR3CQ9C0K3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR3CQ9C0K3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTR3CQ9C0K3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR3CQ9C0K3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR3CQ9C0K3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR3CQ9C0K3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR3CQ9C0K3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTR3CQ9C0K3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR3CQ9C0K3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR3CQ9C0K3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR3CQ9C0K3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR3CQ9C0K3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3CQ9C0K3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3CQ9C0K3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3CQ9C0K3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTR3CQ9C0K3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTR3CQ9C0K3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3CQ9C0K3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTR3CQ9C0K3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR3CQ9C0K3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR3CQ9C0K3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTR3CQ9C0K3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3CQ9C0K3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3CQ9C0K3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3CQ9C0K3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTR3CQ9C0K3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR3CQ9C0K3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3CQ9C0K3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3CQ9C0K3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3CQ9C0K3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3CQ9C0K3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3CQ9C0K3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR3CQ9C0K3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR3CQ9C0K3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR3CQ9C0K3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTR3CQ9C0K3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTR3CQ9C0K3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTR3CQ9C0K3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTR3CQ9C0K3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR3CQ9C0K3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR3CQ9C0K3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR3CQ9C0K3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR3CQ9C0K3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTR3CQ9C0K3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTR3CQ9C0K3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTR3CQ9C0K3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTR3CQ9C0K3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ACTR3CQ9C0K3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR3CQ9C0K3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR3CQ9C0K3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR3CQ9C0K3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR3CQ9C0K3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACTR3CQ9C0K3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTR3CQ9C0K3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTR3CQ9C0K3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACTR3CQ9C0K3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTR3CQ9C0K3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACTR3CQ9C0K3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACTR3CQ9C0K3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTR3CQ9C0K3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACTR3CQ9C0K3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTR3CQ9C0K3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTR3CQ9C0K3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTR3CQ9C0K3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTR3CQ9C0K3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTR3CQ9C0K3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTR3CQ9C0K3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTR3CQ9C0K3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTR3CQ9C0K3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTR3CQ9C0K3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTR3CQ9C0K3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTR3CQ9C0K3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTR3CQ9C0K3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTR3CQ9C0K3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTR3CQ9C0K3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTR3CQ9C0K3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTR3CQ9C0K3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTR3CQ9C0K3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTR3CQ9C0K3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTR3CQ9C0K3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR3CQ9C0K3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTR3CQ9C0K3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR3CQ9C0K3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR3CQ9C0K3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR3CQ9C0K3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR3CQ9C0K3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTR3CQ9C0K3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTR3CQ9C0K3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTR3CQ9C0K3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTR3CQ9C0K3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTR3CQ9C0K3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR3CQ9C0K3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTR3CQ9C0K3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms