Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNHG12Q9BXW3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNHG12Q9BXW3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNHG12Q9BXW3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNHG12Q9BXW3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNHG12Q9BXW3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNHG12Q9BXW3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNHG12Q9BXW3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNHG12Q9BXW3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNHG12Q9BXW3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNHG12Q9BXW3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNHG12Q9BXW3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNHG12Q9BXW3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNHG12Q9BXW3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNHG12Q9BXW3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNHG12Q9BXW3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNHG12Q9BXW3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNHG12Q9BXW3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNHG12Q9BXW3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNHG12Q9BXW3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNHG12Q9BXW3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNHG12Q9BXW3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNHG12Q9BXW3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNHG12Q9BXW3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNHG12Q9BXW3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNHG12Q9BXW3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNHG12Q9BXW3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNHG12Q9BXW3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNHG12Q9BXW3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNHG12Q9BXW3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNHG12Q9BXW3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNHG12Q9BXW3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNHG12Q9BXW3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNHG12Q9BXW3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNHG12Q9BXW3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNHG12Q9BXW3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNHG12Q9BXW3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNHG12Q9BXW3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNHG12Q9BXW3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SNHG12Q9BXW3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNHG12Q9BXW3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNHG12Q9BXW3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNHG12Q9BXW3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNHG12Q9BXW3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNHG12Q9BXW3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNHG12Q9BXW3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNHG12Q9BXW3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNHG12Q9BXW3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNHG12Q9BXW3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNHG12Q9BXW3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNHG12Q9BXW3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNHG12Q9BXW3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNHG12Q9BXW3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNHG12Q9BXW3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNHG12Q9BXW3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNHG12Q9BXW3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNHG12Q9BXW3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNHG12Q9BXW3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNHG12Q9BXW3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNHG12Q9BXW3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNHG12Q9BXW3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNHG12Q9BXW3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNHG12Q9BXW3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNHG12Q9BXW3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNHG12Q9BXW3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNHG12Q9BXW3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNHG12Q9BXW3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNHG12Q9BXW3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNHG12Q9BXW3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNHG12Q9BXW3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNHG12Q9BXW3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNHG12Q9BXW3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNHG12Q9BXW3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNHG12Q9BXW3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNHG12Q9BXW3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNHG12Q9BXW3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNHG12Q9BXW3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNHG12Q9BXW3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNHG12Q9BXW3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNHG12Q9BXW3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNHG12Q9BXW3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNHG12Q9BXW3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNHG12Q9BXW3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNHG12Q9BXW3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNHG12Q9BXW3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNHG12Q9BXW3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNHG12Q9BXW3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNHG12Q9BXW3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNHG12Q9BXW3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNHG12Q9BXW3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNHG12Q9BXW3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNHG12Q9BXW3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNHG12Q9BXW3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNHG12Q9BXW3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNHG12Q9BXW3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNHG12Q9BXW3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNHG12Q9BXW3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNHG12Q9BXW3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNHG12Q9BXW3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNHG12Q9BXW3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms