Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM7

PINK1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PINK1Q9BXM7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PINK1Q9BXM7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PINK1Q9BXM7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PINK1Q9BXM7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PINK1Q9BXM7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PINK1Q9BXM7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PINK1Q9BXM7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PINK1Q9BXM7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PINK1Q9BXM7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PINK1Q9BXM7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PINK1Q9BXM7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PINK1Q9BXM7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PINK1Q9BXM7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PINK1Q9BXM7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PINK1Q9BXM7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PINK1Q9BXM7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PINK1Q9BXM7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PINK1Q9BXM7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PINK1Q9BXM7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PINK1Q9BXM7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PINK1Q9BXM7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PINK1Q9BXM7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PINK1Q9BXM7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PINK1Q9BXM7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PINK1Q9BXM7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PINK1Q9BXM7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PINK1Q9BXM7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PINK1Q9BXM7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PINK1Q9BXM7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PINK1Q9BXM7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PINK1Q9BXM7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PINK1Q9BXM7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PINK1Q9BXM7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PINK1Q9BXM7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PINK1Q9BXM7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PINK1Q9BXM7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PINK1Q9BXM7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PINK1Q9BXM7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PINK1Q9BXM7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PINK1Q9BXM7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PINK1Q9BXM7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PINK1Q9BXM7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PINK1Q9BXM7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PINK1Q9BXM7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PINK1Q9BXM7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PINK1Q9BXM7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PINK1Q9BXM7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PINK1Q9BXM7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PINK1Q9BXM7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PINK1Q9BXM7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PINK1Q9BXM7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PINK1Q9BXM7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PINK1Q9BXM7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PINK1Q9BXM7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PINK1Q9BXM7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PINK1Q9BXM7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PINK1Q9BXM7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PINK1Q9BXM7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PINK1Q9BXM7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PINK1Q9BXM7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PINK1Q9BXM7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PINK1Q9BXM7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PINK1Q9BXM7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PINK1Q9BXM7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PINK1Q9BXM7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PINK1Q9BXM7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PINK1Q9BXM7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PINK1Q9BXM7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PINK1Q9BXM7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PINK1Q9BXM7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PINK1Q9BXM7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PINK1Q9BXM7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PINK1Q9BXM7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PINK1Q9BXM7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PINK1Q9BXM7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PINK1Q9BXM7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PINK1Q9BXM7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PINK1Q9BXM7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PINK1Q9BXM7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PINK1Q9BXM7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PINK1Q9BXM7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PINK1Q9BXM7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PINK1Q9BXM7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PINK1Q9BXM7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PINK1Q9BXM7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PINK1Q9BXM7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PINK1Q9BXM7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PINK1Q9BXM7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PINK1Q9BXM7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PINK1Q9BXM7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PINK1Q9BXM7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PINK1Q9BXM7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PINK1Q9BXM7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PINK1Q9BXM7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PINK1Q9BXM7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PINK1Q9BXM7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PINK1Q9BXM7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PINK1Q9BXM7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PINK1Q9BXM7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PINK1Q9BXM7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms