Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT9

GINS4, DNA replication complex GINS protein SLD5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS4Q9BRT9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINS4Q9BRT9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GINS4Q9BRT9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GINS4Q9BRT9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINS4Q9BRT9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINS4Q9BRT9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GINS4Q9BRT9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINS4Q9BRT9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GINS4Q9BRT9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GINS4Q9BRT9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GINS4Q9BRT9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS4Q9BRT9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS4Q9BRT9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS4Q9BRT9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS4Q9BRT9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS4Q9BRT9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINS4Q9BRT9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINS4Q9BRT9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINS4Q9BRT9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GINS4Q9BRT9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINS4Q9BRT9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINS4Q9BRT9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GINS4Q9BRT9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GINS4Q9BRT9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GINS4Q9BRT9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GINS4Q9BRT9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GINS4Q9BRT9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GINS4Q9BRT9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GINS4Q9BRT9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GINS4Q9BRT9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GINS4Q9BRT9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINS4Q9BRT9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINS4Q9BRT9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINS4Q9BRT9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINS4Q9BRT9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GINS4Q9BRT9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINS4Q9BRT9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINS4Q9BRT9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINS4Q9BRT9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINS4Q9BRT9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GINS4Q9BRT9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINS4Q9BRT9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINS4Q9BRT9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINS4Q9BRT9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GINS4Q9BRT9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GINS4Q9BRT9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GINS4Q9BRT9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINS4Q9BRT9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINS4Q9BRT9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GINS4Q9BRT9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GINS4Q9BRT9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GINS4Q9BRT9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GINS4Q9BRT9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GINS4Q9BRT9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GINS4Q9BRT9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS4Q9BRT9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS4Q9BRT9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS4Q9BRT9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS4Q9BRT9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS4Q9BRT9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS4Q9BRT9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS4Q9BRT9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS4Q9BRT9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS4Q9BRT9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS4Q9BRT9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS4Q9BRT9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS4Q9BRT9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS4Q9BRT9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINS4Q9BRT9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINS4Q9BRT9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINS4Q9BRT9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINS4Q9BRT9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINS4Q9BRT9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINS4Q9BRT9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINS4Q9BRT9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINS4Q9BRT9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINS4Q9BRT9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINS4Q9BRT9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINS4Q9BRT9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GINS4Q9BRT9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINS4Q9BRT9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINS4Q9BRT9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GINS4Q9BRT9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINS4Q9BRT9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINS4Q9BRT9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINS4Q9BRT9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GINS4Q9BRT9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GINS4Q9BRT9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINS4Q9BRT9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINS4Q9BRT9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GINS4Q9BRT9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GINS4Q9BRT9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS4Q9BRT9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GINS4Q9BRT9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINS4Q9BRT9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINS4Q9BRT9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINS4Q9BRT9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINS4Q9BRT9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINS4Q9BRT9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINS4Q9BRT9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms