Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF6BQ99941 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF6BQ99941 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF6BQ99941 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF6BQ99941 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF6BQ99941 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF6BQ99941 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF6BQ99941 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF6BQ99941 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF6BQ99941 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF6BQ99941 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF6BQ99941 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF6BQ99941 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF6BQ99941 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF6BQ99941 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF6BQ99941 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF6BQ99941 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF6BQ99941 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF6BQ99941 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATF6BQ99941 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF6BQ99941 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF6BQ99941 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF6BQ99941 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF6BQ99941 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF6BQ99941 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF6BQ99941 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF6BQ99941 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF6BQ99941 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATF6BQ99941 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF6BQ99941 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF6BQ99941 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF6BQ99941 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF6BQ99941 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF6BQ99941 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATF6BQ99941 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATF6BQ99941 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATF6BQ99941 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATF6BQ99941 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATF6BQ99941 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF6BQ99941 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATF6BQ99941 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF6BQ99941 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATF6BQ99941 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF6BQ99941 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF6BQ99941 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATF6BQ99941 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF6BQ99941 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF6BQ99941 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF6BQ99941 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATF6BQ99941 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATF6BQ99941 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF6BQ99941 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF6BQ99941 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF6BQ99941 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATF6BQ99941 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF6BQ99941 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF6BQ99941 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATF6BQ99941 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF6BQ99941 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATF6BQ99941 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF6BQ99941 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATF6BQ99941 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF6BQ99941 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF6BQ99941 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF6BQ99941 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF6BQ99941 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATF6BQ99941 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF6BQ99941 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF6BQ99941 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATF6BQ99941 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATF6BQ99941 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF6BQ99941 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ATF6BQ99941 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF6BQ99941 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF6BQ99941 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF6BQ99941 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATF6BQ99941 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATF6BQ99941 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATF6BQ99941 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF6BQ99941 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF6BQ99941 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATF6BQ99941 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF6BQ99941 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF6BQ99941 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATF6BQ99941 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF6BQ99941 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF6BQ99941 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF6BQ99941 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF6BQ99941 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATF6BQ99941 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATF6BQ99941 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATF6BQ99941 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF6BQ99941 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF6BQ99941 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATF6BQ99941 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF6BQ99941 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF6BQ99941 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATF6BQ99941 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF6BQ99941 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF6BQ99941 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms