Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATF6BQ99941 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATF6BQ99941 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATF6BQ99941 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATF6BQ99941 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ATF6BQ99941 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ATF6BQ99941 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATF6BQ99941 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATF6BQ99941 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATF6BQ99941 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATF6BQ99941 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATF6BQ99941 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATF6BQ99941 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATF6BQ99941 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF6BQ99941 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATF6BQ99941 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF6BQ99941 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATF6BQ99941 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATF6BQ99941 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATF6BQ99941 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF6BQ99941 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF6BQ99941 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF6BQ99941 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF6BQ99941 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATF6BQ99941 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATF6BQ99941 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATF6BQ99941 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF6BQ99941 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF6BQ99941 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF6BQ99941 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF6BQ99941 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATF6BQ99941 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF6BQ99941 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF6BQ99941 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATF6BQ99941 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATF6BQ99941 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATF6BQ99941 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF6BQ99941 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATF6BQ99941 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATF6BQ99941 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF6BQ99941 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATF6BQ99941 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATF6BQ99941 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF6BQ99941 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF6BQ99941 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF6BQ99941 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF6BQ99941 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF6BQ99941 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF6BQ99941 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF6BQ99941 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATF6BQ99941 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATF6BQ99941 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATF6BQ99941 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF6BQ99941 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATF6BQ99941 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF6BQ99941 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF6BQ99941 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF6BQ99941 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF6BQ99941 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATF6BQ99941 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATF6BQ99941 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF6BQ99941 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF6BQ99941 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF6BQ99941 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF6BQ99941 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF6BQ99941 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF6BQ99941 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF6BQ99941 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATF6BQ99941 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF6BQ99941 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF6BQ99941 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF6BQ99941 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF6BQ99941 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF6BQ99941 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF6BQ99941 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF6BQ99941 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF6BQ99941 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF6BQ99941 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATF6BQ99941 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATF6BQ99941 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATF6BQ99941 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATF6BQ99941 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF6BQ99941 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF6BQ99941 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF6BQ99941 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF6BQ99941 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF6BQ99941 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF6BQ99941 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF6BQ99941 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF6BQ99941 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF6BQ99941 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF6BQ99941 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF6BQ99941 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF6BQ99941 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF6BQ99941 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATF6BQ99941 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF6BQ99941 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATF6BQ99941 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATF6BQ99941 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATF6BQ99941 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms