Protein–RNA interactions for Protein: Q99909

SSX3, Protein SSX3, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX3Q99909 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX3Q99909 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX3Q99909 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX3Q99909 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX3Q99909 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSX3Q99909 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSX3Q99909 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX3Q99909 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SSX3Q99909 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SSX3Q99909 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SSX3Q99909 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SSX3Q99909 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX3Q99909 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SSX3Q99909 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX3Q99909 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SSX3Q99909 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX3Q99909 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX3Q99909 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX3Q99909 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX3Q99909 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX3Q99909 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX3Q99909 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX3Q99909 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX3Q99909 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX3Q99909 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX3Q99909 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX3Q99909 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX3Q99909 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX3Q99909 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX3Q99909 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SSX3Q99909 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX3Q99909 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX3Q99909 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX3Q99909 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX3Q99909 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX3Q99909 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX3Q99909 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX3Q99909 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX3Q99909 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX3Q99909 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX3Q99909 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX3Q99909 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX3Q99909 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX3Q99909 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX3Q99909 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX3Q99909 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX3Q99909 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX3Q99909 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX3Q99909 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX3Q99909 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX3Q99909 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX3Q99909 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX3Q99909 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX3Q99909 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX3Q99909 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX3Q99909 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX3Q99909 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX3Q99909 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX3Q99909 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX3Q99909 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX3Q99909 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX3Q99909 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX3Q99909 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX3Q99909 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX3Q99909 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX3Q99909 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX3Q99909 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX3Q99909 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX3Q99909 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX3Q99909 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX3Q99909 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX3Q99909 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX3Q99909 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX3Q99909 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX3Q99909 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX3Q99909 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX3Q99909 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX3Q99909 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX3Q99909 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSX3Q99909 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX3Q99909 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX3Q99909 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX3Q99909 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX3Q99909 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX3Q99909 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX3Q99909 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX3Q99909 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX3Q99909 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX3Q99909 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX3Q99909 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX3Q99909 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX3Q99909 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX3Q99909 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX3Q99909 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX3Q99909 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX3Q99909 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX3Q99909 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX3Q99909 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX3Q99909 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSX3Q99909 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms