Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRNT1Q96Q11 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRNT1Q96Q11 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRNT1Q96Q11 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRNT1Q96Q11 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRNT1Q96Q11 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRNT1Q96Q11 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRNT1Q96Q11 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRNT1Q96Q11 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRNT1Q96Q11 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRNT1Q96Q11 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRNT1Q96Q11 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRNT1Q96Q11 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRNT1Q96Q11 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRNT1Q96Q11 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRNT1Q96Q11 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRNT1Q96Q11 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRNT1Q96Q11 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRNT1Q96Q11 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRNT1Q96Q11 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRNT1Q96Q11 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRNT1Q96Q11 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRNT1Q96Q11 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRNT1Q96Q11 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRNT1Q96Q11 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRNT1Q96Q11 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRNT1Q96Q11 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRNT1Q96Q11 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRNT1Q96Q11 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRNT1Q96Q11 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRNT1Q96Q11 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRNT1Q96Q11 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRNT1Q96Q11 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRNT1Q96Q11 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRNT1Q96Q11 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRNT1Q96Q11 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRNT1Q96Q11 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRNT1Q96Q11 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms