Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC9Q96Q05 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC9Q96Q05 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC9Q96Q05 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC9Q96Q05 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC9Q96Q05 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC9Q96Q05 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC9Q96Q05 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC9Q96Q05 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC9Q96Q05 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC9Q96Q05 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC9Q96Q05 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC9Q96Q05 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC9Q96Q05 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC9Q96Q05 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC9Q96Q05 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC9Q96Q05 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC9Q96Q05 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC9Q96Q05 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRAPPC9Q96Q05 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC9Q96Q05 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC9Q96Q05 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC9Q96Q05 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC9Q96Q05 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC9Q96Q05 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC9Q96Q05 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC9Q96Q05 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC9Q96Q05 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC9Q96Q05 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC9Q96Q05 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC9Q96Q05 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC9Q96Q05 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC9Q96Q05 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC9Q96Q05 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC9Q96Q05 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC9Q96Q05 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC9Q96Q05 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC9Q96Q05 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC9Q96Q05 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC9Q96Q05 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC9Q96Q05 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC9Q96Q05 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC9Q96Q05 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC9Q96Q05 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC9Q96Q05 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC9Q96Q05 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC9Q96Q05 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC9Q96Q05 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC9Q96Q05 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC9Q96Q05 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC9Q96Q05 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC9Q96Q05 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC9Q96Q05 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC9Q96Q05 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC9Q96Q05 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC9Q96Q05 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC9Q96Q05 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC9Q96Q05 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC9Q96Q05 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC9Q96Q05 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC9Q96Q05 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC9Q96Q05 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC9Q96Q05 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC9Q96Q05 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC9Q96Q05 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC9Q96Q05 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC9Q96Q05 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC9Q96Q05 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC9Q96Q05 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC9Q96Q05 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC9Q96Q05 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC9Q96Q05 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC9Q96Q05 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC9Q96Q05 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC9Q96Q05 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC9Q96Q05 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC9Q96Q05 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC9Q96Q05 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC9Q96Q05 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC9Q96Q05 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC9Q96Q05 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC9Q96Q05 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC9Q96Q05 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC9Q96Q05 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC9Q96Q05 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC9Q96Q05 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC9Q96Q05 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRAPPC9Q96Q05 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC9Q96Q05 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC9Q96Q05 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC9Q96Q05 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC9Q96Q05 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC9Q96Q05 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC9Q96Q05 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC9Q96Q05 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC9Q96Q05 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC9Q96Q05 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms