Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00208Q96KT6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00208Q96KT6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00208Q96KT6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00208Q96KT6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00208Q96KT6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00208Q96KT6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00208Q96KT6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00208Q96KT6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00208Q96KT6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00208Q96KT6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00208Q96KT6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00208Q96KT6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00208Q96KT6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00208Q96KT6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00208Q96KT6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00208Q96KT6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00208Q96KT6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00208Q96KT6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00208Q96KT6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00208Q96KT6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00208Q96KT6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00208Q96KT6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00208Q96KT6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00208Q96KT6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00208Q96KT6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00208Q96KT6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00208Q96KT6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00208Q96KT6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00208Q96KT6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00208Q96KT6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00208Q96KT6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00208Q96KT6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00208Q96KT6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00208Q96KT6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00208Q96KT6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00208Q96KT6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00208Q96KT6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00208Q96KT6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00208Q96KT6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00208Q96KT6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00208Q96KT6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00208Q96KT6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00208Q96KT6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00208Q96KT6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00208Q96KT6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00208Q96KT6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00208Q96KT6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00208Q96KT6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00208Q96KT6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00208Q96KT6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00208Q96KT6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00208Q96KT6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00208Q96KT6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00208Q96KT6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00208Q96KT6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00208Q96KT6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00208Q96KT6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00208Q96KT6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00208Q96KT6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00208Q96KT6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00208Q96KT6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00208Q96KT6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00208Q96KT6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00208Q96KT6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00208Q96KT6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00208Q96KT6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00208Q96KT6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00208Q96KT6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00208Q96KT6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00208Q96KT6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00208Q96KT6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00208Q96KT6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00208Q96KT6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00208Q96KT6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00208Q96KT6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00208Q96KT6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00208Q96KT6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00208Q96KT6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00208Q96KT6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms