Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00208Q96KT6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00208Q96KT6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00208Q96KT6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00208Q96KT6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00208Q96KT6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00208Q96KT6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00208Q96KT6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00208Q96KT6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00208Q96KT6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00208Q96KT6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00208Q96KT6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00208Q96KT6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00208Q96KT6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00208Q96KT6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00208Q96KT6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00208Q96KT6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00208Q96KT6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00208Q96KT6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00208Q96KT6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00208Q96KT6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00208Q96KT6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00208Q96KT6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00208Q96KT6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00208Q96KT6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00208Q96KT6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00208Q96KT6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00208Q96KT6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00208Q96KT6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00208Q96KT6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00208Q96KT6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00208Q96KT6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00208Q96KT6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00208Q96KT6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00208Q96KT6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00208Q96KT6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00208Q96KT6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00208Q96KT6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00208Q96KT6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00208Q96KT6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00208Q96KT6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00208Q96KT6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00208Q96KT6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00208Q96KT6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00208Q96KT6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00208Q96KT6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00208Q96KT6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00208Q96KT6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00208Q96KT6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00208Q96KT6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00208Q96KT6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00208Q96KT6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00208Q96KT6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00208Q96KT6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00208Q96KT6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00208Q96KT6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00208Q96KT6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00208Q96KT6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00208Q96KT6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00208Q96KT6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00208Q96KT6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00208Q96KT6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00208Q96KT6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00208Q96KT6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00208Q96KT6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00208Q96KT6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00208Q96KT6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00208Q96KT6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00208Q96KT6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00208Q96KT6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00208Q96KT6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00208Q96KT6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00208Q96KT6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00208Q96KT6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00208Q96KT6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00208Q96KT6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00208Q96KT6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00208Q96KT6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00208Q96KT6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00208Q96KT6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00208Q96KT6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00208Q96KT6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00208Q96KT6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00208Q96KT6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00208Q96KT6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00208Q96KT6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00208Q96KT6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00208Q96KT6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00208Q96KT6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC00208Q96KT6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00208Q96KT6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00208Q96KT6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC00208Q96KT6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00208Q96KT6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00208Q96KT6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00208Q96KT6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00208Q96KT6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00208Q96KT6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00208Q96KT6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00208Q96KT6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms