Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDLIM2Q96JY6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDLIM2Q96JY6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PDLIM2Q96JY6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PDLIM2Q96JY6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PDLIM2Q96JY6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PDLIM2Q96JY6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PDLIM2Q96JY6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PDLIM2Q96JY6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
PDLIM2Q96JY6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PDLIM2Q96JY6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PDLIM2Q96JY6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PDLIM2Q96JY6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PDLIM2Q96JY6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PDLIM2Q96JY6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PDLIM2Q96JY6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PDLIM2Q96JY6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PDLIM2Q96JY6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PDLIM2Q96JY6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PDLIM2Q96JY6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PDLIM2Q96JY6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PDLIM2Q96JY6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PDLIM2Q96JY6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PDLIM2Q96JY6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PDLIM2Q96JY6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PDLIM2Q96JY6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PDLIM2Q96JY6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PDLIM2Q96JY6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PDLIM2Q96JY6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PDLIM2Q96JY6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PDLIM2Q96JY6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PDLIM2Q96JY6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PDLIM2Q96JY6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PDLIM2Q96JY6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PDLIM2Q96JY6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDLIM2Q96JY6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PDLIM2Q96JY6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PDLIM2Q96JY6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PDLIM2Q96JY6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PDLIM2Q96JY6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDLIM2Q96JY6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDLIM2Q96JY6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PDLIM2Q96JY6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PDLIM2Q96JY6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PDLIM2Q96JY6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PDLIM2Q96JY6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PDLIM2Q96JY6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDLIM2Q96JY6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDLIM2Q96JY6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDLIM2Q96JY6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PDLIM2Q96JY6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PDLIM2Q96JY6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PDLIM2Q96JY6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PDLIM2Q96JY6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PDLIM2Q96JY6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PDLIM2Q96JY6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PDLIM2Q96JY6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PDLIM2Q96JY6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PDLIM2Q96JY6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PDLIM2Q96JY6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PDLIM2Q96JY6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDLIM2Q96JY6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PDLIM2Q96JY6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PDLIM2Q96JY6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDLIM2Q96JY6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDLIM2Q96JY6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PDLIM2Q96JY6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PDLIM2Q96JY6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PDLIM2Q96JY6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PDLIM2Q96JY6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PDLIM2Q96JY6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PDLIM2Q96JY6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PDLIM2Q96JY6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDLIM2Q96JY6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PDLIM2Q96JY6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDLIM2Q96JY6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDLIM2Q96JY6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PDLIM2Q96JY6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PDLIM2Q96JY6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDLIM2Q96JY6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDLIM2Q96JY6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDLIM2Q96JY6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDLIM2Q96JY6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PDLIM2Q96JY6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PDLIM2Q96JY6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PDLIM2Q96JY6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PDLIM2Q96JY6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PDLIM2Q96JY6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PDLIM2Q96JY6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PDLIM2Q96JY6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PDLIM2Q96JY6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PDLIM2Q96JY6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PDLIM2Q96JY6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PDLIM2Q96JY6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PDLIM2Q96JY6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDLIM2Q96JY6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PDLIM2Q96JY6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDLIM2Q96JY6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDLIM2Q96JY6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PDLIM2Q96JY6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms