Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPNE2Q96FN4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPNE2Q96FN4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPNE2Q96FN4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPNE2Q96FN4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPNE2Q96FN4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPNE2Q96FN4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPNE2Q96FN4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPNE2Q96FN4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPNE2Q96FN4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPNE2Q96FN4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CPNE2Q96FN4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPNE2Q96FN4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPNE2Q96FN4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPNE2Q96FN4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPNE2Q96FN4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPNE2Q96FN4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPNE2Q96FN4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPNE2Q96FN4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPNE2Q96FN4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPNE2Q96FN4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPNE2Q96FN4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPNE2Q96FN4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPNE2Q96FN4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPNE2Q96FN4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPNE2Q96FN4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPNE2Q96FN4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPNE2Q96FN4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPNE2Q96FN4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPNE2Q96FN4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CPNE2Q96FN4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPNE2Q96FN4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPNE2Q96FN4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPNE2Q96FN4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPNE2Q96FN4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPNE2Q96FN4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPNE2Q96FN4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPNE2Q96FN4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPNE2Q96FN4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE2Q96FN4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE2Q96FN4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE2Q96FN4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPNE2Q96FN4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPNE2Q96FN4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPNE2Q96FN4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPNE2Q96FN4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPNE2Q96FN4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPNE2Q96FN4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPNE2Q96FN4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPNE2Q96FN4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPNE2Q96FN4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPNE2Q96FN4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPNE2Q96FN4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE2Q96FN4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE2Q96FN4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPNE2Q96FN4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPNE2Q96FN4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPNE2Q96FN4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPNE2Q96FN4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPNE2Q96FN4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPNE2Q96FN4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPNE2Q96FN4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE2Q96FN4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE2Q96FN4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE2Q96FN4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPNE2Q96FN4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPNE2Q96FN4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPNE2Q96FN4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPNE2Q96FN4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE2Q96FN4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPNE2Q96FN4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPNE2Q96FN4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPNE2Q96FN4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPNE2Q96FN4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPNE2Q96FN4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE2Q96FN4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE2Q96FN4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE2Q96FN4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE2Q96FN4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE2Q96FN4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPNE2Q96FN4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPNE2Q96FN4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE2Q96FN4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPNE2Q96FN4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE2Q96FN4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE2Q96FN4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE2Q96FN4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE2Q96FN4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE2Q96FN4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE2Q96FN4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CPNE2Q96FN4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CPNE2Q96FN4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE2Q96FN4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CPNE2Q96FN4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE2Q96FN4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE2Q96FN4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CPNE2Q96FN4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE2Q96FN4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE2Q96FN4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CPNE2Q96FN4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms